Tabla de cambio de valor de P y FDR para la comparación de gruposTengo conjuntos de datos con muchas variables de respuesta (~ 15K) y muchas muestras (~ 7K). He agrupado las muestras basadas en el conocimiento previo en 10 grupos y necesito definir las variables que son características para cada uno. Quiero generar una tabla / matriz que enumere todas las variables frente a los grupos, con el cambio de plegado (relación) en los valores de respuesta promedio (cada grupo frente a todas las otras muestras juntas) con valores de P (corregidos o no) y FDR si es posible .
Esperando que haya una forma sencilla de generar esto. ANOVA o opciones binomiales negativas serían útiles.
Re: tabla de cambio de valor de P y FDR para la comparación de gruposMi experiencia en tales casos fue en virología cuando la información útil se duplicó pero la respuesta fue de título. Por lo tanto, una transformación podría hacer que la respuesta sea más significativa transformándose como Ln (título) / Ln (2). (Esa es efectivamente la base logarítmica 2.) Puede realizar esta transformación con una fórmula de columna sin la necesidad de un script separado.
Re: tabla de cambio de valor de P y FDR para la comparación de gruposLa selección de respuesta da la diferencia en los medios. Sin embargo, para nuestros propósitos, la diferencia en los valores medios no es tan relevante como la diferencia en las proporciones de cada media de grupo a la totalidad.
Por lo tanto, se necesita una tabla de cambio de pliegue con valores de P y FDR. Me pregunto si están disponibles los scripts que hacen esto.
Gracias
Re: tabla de cambio de valor de P y FDR para la comparación de gruposLe sugiero que mire las herramientas de detección: Analizar> Detección> Detección de respuesta. A menudo utilizo la plataforma de detección de respuestas para lo que creo que estás tratando de hacer. La documentación está en:
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml
