群の比較のための倍数変化P値およびFDRの表私は多くの応答変数(〜15K)と多くのサンプル(〜7K)を持つデータセットを持っています。 事前の知識に基づいてサンプルを10個のクラスターにクラスター化し、それぞれに固有の変数を定義する必要があります。 平均値(各クラスタと他のすべてのサンプルを合わせたもの)の倍数変化(比率)とP値(修正されているかどうかにかかわらず)および可能であればFDRを使用。
これを生成する簡単な方法があることを願っています。 ANOVAまたは負の二項オプションが役立ちます。
群の比較のための倍数変化P値およびFDRの表に関してそのような場合の私の経験は、有用な情報が2倍になったが応答が力価だったときにウイルス学でした。そのため、変換はLn(力価)/ Ln(2)のように応答をより意味のある変換にすることができます。これは実質的に対数2の対数です。別のスクリプトを使用することなく、列の式を使用してこの変換を実行できます。
群の比較のための倍数変化P値およびFDRの表に関して応答スクリーニングでは平均値に違いがあります。 しかしながら、我々の目的のためには、平均値の違いは、各グループの全体に対する割合の違いの違いほど重要ではありません。
したがって、P値とFDRによる倍率変化の表が必要です。彼らはこれを行う利用可能なスクリプトであるのだろうか。
ありがとう
群の比較のための倍数変化P値およびFDRの表に関してスクリーニングツールを見ることをお勧めします:分析>スクリーニング>応答スクリーニング。 私はあなたがやろうとしていると思うことのために私はしばしば応答スクリーニングプラットフォームを使います。 ドキュメントは次の場所にあります。
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml