tabella di piega modifica il valore P e FDR per il confronto dei gruppiHo serie di dati con molte variabili di risposta (~ 15K) e molti campioni (~ 7K). Ho raggruppato i campioni in base alla conoscenza precedente in 10 cluster e ho bisogno di definire le variabili che sono caratteristiche per ciascuno. Voglio generare una tabella / matrice che elenca tutte le variabili rispetto ai cluster, con il cambiamento di piega (rapporto) nei valori di risposta media (ogni cluster rispetto a tutti gli altri campioni insieme) con valori P (corretti o non corretti) e FDR se possibile .
Sperando ci sia un modo semplice per generare questo. Sarebbe utile l'ANOVA o le opzioni binomiali negative.
Re: tabella del valore P della variazione della piegatura e FDR per il confronto dei gruppiLa mia esperienza in questi casi era in virologia quando le informazioni utili erano un raddoppio, ma la risposta era il titolo. Quindi una trasformazione potrebbe rendere la risposta una trasformazione più significativa come Ln (titolo) / Ln (2). (Questa è in effetti la base del logaritmo 2.) È possibile eseguire questa trasformazione con una formula di colonna senza la necessità di uno script separato.
Re: tabella del valore P della variazione della piegatura e FDR per il confronto dei gruppiLo screening delle risposte dà la differenza nei mezzi. Tuttavia, per i nostri scopi, la differenza nei valori medi non è tanto rilevante quanto la differenza nei rapporti di ciascun gruppo di persone rispetto all'intero.
Quindi una tabella di cambio di piega con valori P e FDR è necessaria. Mi chiedo se i loro sono script disponibili che fanno questo.
Grazie
Re: tabella del valore P della variazione della piegatura e FDR per il confronto dei gruppiTi suggerisco di guardare gli strumenti di screening: Analizza> Screening> Screening delle risposte. Io uso spesso la piattaforma di screening delle risposte per ciò che penso tu stia cercando di fare. Il documentaiton è a:
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml
