Tabelle der Falzänderung P-Wert und FDR zum Vergleich von GruppenIch habe Datensätze mit vielen Antwortvariablen (~ 15K) und vielen Beispielen (~ 7K). Ich habe die Stichproben auf der Grundlage von Vorkenntnissen in 10 Cluster gruppiert und muss die für jeden charakteristischen Variablen definieren. Ich möchte eine Tabelle / Matrix generieren, die alle Variablen gegenüber den Clustern auflistet, mit der Faltänderung (Verhältnis) in den mittleren Antwortwerten (jeder Cluster gegenüber allen anderen Proben zusammen) mit P-Werten (entweder korrigiert oder nicht) und FDR, falls möglich .
Ich hoffe, es gibt eine einfache Möglichkeit, dies zu generieren. ANOVA oder negative binomische Optionen wären hilfreich.
Re: Tabelle der Falzänderung P-Wert und FDR zum Vergleich von GruppenMeine Erfahrung in solchen Fällen war in der Virologie, als die nützliche Information eine Verdopplung war, aber die Reaktion Titer war. Eine Transformation könnte also die Antwort sinnvoller machen als Ln (Titer) / Ln (2). (Das ist praktisch die Logarithmus-Basis 2.) Sie können diese Umwandlung mit einer Spaltenformel durchführen, ohne dass ein separates Skript erforderlich ist.
Re: Tabelle der Falzänderung P-Wert und FDR zum Vergleich von GruppenDas Antwortscreening gibt den Unterschied in den Mittelwerten an. Für unsere Zwecke ist der Unterschied in den Mittelwerten jedoch nicht so relevant wie der Unterschied in den Verhältnissen der einzelnen Mittelwerte zum Gesamtwert.
Daher ist eine Tabelle der Faltänderung mit P-Werten und FDR erforderlich. Ich frage mich, ob es verfügbare Skripte gibt, die dies tun.
Vielen Dank
Re: Tabelle der Falzänderung P-Wert und FDR zum Vergleich von GruppenIch würde vorschlagen, dass Sie sich die Screening-Tools ansehen: Analysieren> Screening> Antwortscreening. Ich benutze oft die Response-Screening-Plattform für das, was Sie meiner Meinung nach versuchen. Die Dokumentation ist unter:
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml
