tableau de la valeur P et FDR du changement de pli pour la comparaison des groupesJ'ai des ensembles de données avec de nombreuses variables de réponse (~ 15K) et de nombreux échantillons (~ 7K). J'ai regroupé les échantillons en 10 groupes sur la base de connaissances préalables et je dois définir les variables caractéristiques de chacun. Je veux générer un tableau / matrice qui répertorie toutes les variables par rapport aux grappes, avec le facteur de variation (rapport) des valeurs de réponse moyennes (chaque grappe par rapport à tous les autres échantillons) avec les valeurs P (corrigées ou non) et le FDR si possible .
En espérant qu'il existe un moyen simple de générer cela. ANOVA ou options binomiales négatives seraient utiles.
Re: tableau de la valeur P et FDR du changement de pli pour la comparaison des groupesMon expérience dans de tels cas était en virologie lorsque l'information utile était un doublé mais que la réponse était titrée. Ainsi, une transformation pourrait rendre la réponse plus significative en transformant Ln (titre) / Ln (2). (Il s’agit bien du logarithme en base 2.) Vous pouvez effectuer cette transformation avec une formule de colonne sans recourir à un script séparé.
Re: tableau de la valeur P et FDR du changement de pli pour la comparaison des groupesLe dépistage de la réponse donne la différence en moyenne. Toutefois, pour nos besoins, la différence entre les valeurs moyennes n’est pas aussi pertinente que la différence entre les rapports de chaque groupe et la moyenne.
Par conséquent, une table de changement de pli avec des valeurs de P et FDR est nécessaire. Je me demande si ce sont des scripts disponibles qui font cela.
Merci
Re: tableau de la valeur P et FDR du changement de pli pour la comparaison des groupesJe vous suggère de consulter les outils de dépistage: Analyser> Criblage> Criblage des réponses. J'utilise souvent la plate-forme de filtrage des réponses pour ce que je pense que vous essayez de faire. La documentation est à:
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml
