折疊表P值和FDR用於比較組我有許多響應變量（~15K）和許多樣本（~7K）的數據集。 我已經將基於先驗知識的樣本聚類到10個聚類中，並且需要定義每個聚類的特徵變量。 我想生成一個表/矩陣，列出所有變量與集群的關係，平均響應值（每個集群與所有其他樣本一起）的倍數變化（比率）與P值（校正與否）和FDR（如果可能） 。
希望有一種簡單的方法來生成它。 ANOVA或負二項選項會有所幫助。
Re：用於比較組的倍數變化P值和FDR表我在這種病例中的經驗是病毒學，當有用信息翻倍但反應是滴度。因此，轉換可以使響應更有意義轉換為Ln（titer）/ Ln（2）。（這實際上是對數基數2.）您可以使用列公式進行此轉換，而無需單獨的腳本。
Re：用於比較組的倍數變化P值和FDR表響應篩選給出了手段上的差異。 然而，就我們的目的而言，平均值的差異與每個gropup均值與整體的比率的差異並不相關。
因此需要具有P值和FDR的倍數變化表。我想知道他們是否可以使用這些腳本。
謝謝
Re：用於比較組的倍數變化P值和FDR表我建議你看一下篩選工具：分析>篩選>反應篩選。 我經常使用響應篩選平台來實現我認為你想要做的事情。 該文件位於：
https://www.jmp.com/support/help/14/response-screening.shtml
