quanto è lunga la stima degli aplotipi?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Ciao,
Ho interrotto una stima aplotipica di oltre 200k snps dopo 24 ore. ci sta mettendo così tanto tempo o mi sto perdendo un sonoro?
Ri: quanto è lunga la stima degli aplotipi?Grazie. Ho usato la dimensione della finestra predefinita di 5 SNP senza sovrapposizioni.
Ri: quanto è lunga la stima degli aplotipi?Quanto è grande la dimensione della finestra scorrevole che stai utilizzando per la stima degli aplotipi? Questo processo utilizza l'algoritmo EM per stimare gli aplotipi attraverso una dimensione della finestra dei marcatori. Può diventare estremamente intensivo dal punto di vista computazionale con un gran numero di marker, specialmente se si sta tentando di creare grandi dimensioni di haplotypes di Windows. Non è insolito per questo avere tempi di esecuzione lunghi.
