Wie lange dauert die Haplotyp-Schätzung?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Hallo,
Ich stoppte nach 24 Stunden eine Haplotypschätzung von über 200 kps. dauert es so lange oder fehlt mir etwas?
Betreff: Wie lange dauert die Haplotyp-Schätzung?Vielen Dank. Ich habe die Standardfenstergröße von 5 SNPs ohne Überlappung verwendet.
Betreff: Wie lange dauert die Haplotyp-Schätzung?Wie groß ist die Schiebefenstergröße, die Sie zur Abschätzung von Haplotypen verwenden? Dieser Prozess verwendet den EM-Algorithmus, um Haplotypen über eine Fenstergröße von Markierungen zu schätzen. Bei einer großen Anzahl von Markern kann dies äußerst rechenintensiv werden, insbesondere wenn Sie versuchen, große Fenstergrößen für Haplotypen zu erstellen. Es ist nicht ungewöhnlich, dass dies lange Laufzeiten hat.
