Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellHallo,
Ich bin neu bei JMP und hoffe, dass Sie mir helfen können!
Bei meinem Experiment handelte es sich um ein randomisiertes vollständiges Block-2x2-Fakultätsdesign mit zwei Ebenen zusätzlicher Additive. Insgesamt wurden 480 Individuen in 5er-Pferdeställen untergebracht (der Pferch fungiert als Versuchseinheit, nicht als Einzeltier), und die Pferche innerhalb einer Wiederholung wurden einer der 4 Ernährungsbehandlungen zugewiesen. Ich hatte insgesamt 24 Wiederholungen, aber das Experiment wurde über zwei Chargen durchgeführt, die ersten 240 Personen (12 Wiederholungen) im Februar und die zweite Charge mit 240 Personen (12 Wiederholungen) im April. Ich muss daher eine Kontosperre für Repräsentanten und eine Kontosperre für Stapel erstellen.
Ich möchte nur überprüfen, ob ich die ANOVA richtig durchführe. Im Feld „Modelleffekte konstruieren“ habe ich meine beiden Faktoren, ihre Interaktion, Batch und Rep, ist das korrekt? Wenn ich das mache, verliert dieser Stapel jedoch seinen DF (wie im Bild), also bin ich mir nicht sicher, was ich tun soll?
Ich muss für einige der Analysen auch eine Kovariate für die Startgewichtung hinzufügen. Gehört diese auch in das Feld „Modelleffekte konstruieren“ oder sollten kontinuierliche Kovariaten in ein anderes Feld fallen?
Danke!
Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellUm die Antwort zu vervollständigen, erfahren Sie hier, wie Sie den Bericht dann zur Interpretation dieser Analyse verwenden können.
• Die drei wichtigsten Teile des Berichts sollten einigermaßen vertraut sein. Sie können die Bedeutung Ihrer festen Behandlungseffekte erkennen. Das ist wichtig, denn das sind die Effekte, die von Interesse sind. Der Rest des Berichts erzählt größtenteils nur von den zufälligen Effekten, die Ihrer Meinung nach Varianzquellen sind, die Sie aber nicht wirklich interessieren.
• Mithilfe von Zufallseffektvorhersagen erhalten Sie Schätzungen über die Auswirkung der Differenz für jede Wiederholung
• Die REML-Varianzkomponenten verraten Ihnen, wie die Varianz Ihren Zufallseffekten (in diesem Fall Rep und Batch) zugeordnet wird.
• Weitere Effektdetails finden Sie weiter unten.
• Sie können auch die geschätzten Mittelwerte der Reaktion für jede Ebene Ihrer Zufallseffekte (in diesem Fall Rep und Batch) sehen.
Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellOkay, ich glaube, ich verstehe, was da passiert ist. Die Angabe verschachtelter Effekte ist nicht trivial!
Ich denke, was Sie dort haben, ist Batch, das in Rep - Batch[Rep] verschachtelt ist. Sie möchten hingegen, dass Rep in Batch verschachtelt ist – Rep[Batch]. Ich denke, Sie sollten auch Batch als Effekt haben. Und sowohl Rep[Batch] als auch Batch sollten zufällige Effekte sein.
In der JMP-Dokumentation finden Sie ein Beispiel für ein verschachteltes Zufallseffektmodell Hier . Es stammt aus einer ganz anderen Branche und Anwendung, sollte aber Sinn machen.
Phil
Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellHallo Phil,
Entschuldigung, ich hoffe, Sie können es jetzt sehen
Tegan
Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellDas macht Sinn.
Ich kann das Bild nicht sehen. Ich glaube nicht, dass Sie es richtig angehängt haben (leider können Sie nicht einfach Bilder einfügen).Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellHallo Phil,
Danke für deine Antwort.
Ja, das ist richtig, ich habe also 96 Datenzeilen.
Daher muss die Wiederholung einbezogen werden, da die Individuen entsprechend ihrem Gewicht zugewiesen wurden, sodass die Buchten innerhalb der Wiederholung ausgeglichen waren. So sind beispielsweise die 4 Buchten in Wiederholung 1, die unterschiedlichen Behandlungen unterzogen werden, hinsichtlich ihres Gewichts ausgeglichen, und das Gleiche gilt für Wiederholung 2 usw. Wiederholung 1 könnte also im Wesentlichen ein höheres Durchschnittsgewicht haben als Wiederholung 2. Sie sind auch hinsichtlich Geschlecht und Wurfherkunft innerhalb der Wiederholung ausgewogen.
Es hört sich also so an, als müsste ich sie als zufällige Effekte und verschachtelte Wiederholungen in den Stapel einbinden. Bitte sehen Sie sich das beigefügte Bild an. Was bedeutet es, wenn die Fehlermeldung angezeigt wird, dass kein Abfang erfolgt ist? (Die herausgekritzelten Teile sind nur meine beiden Faktoren und deren Wechselwirkung).
Danke,
Tegan
[cid:image001.png@01D4BFA0.3B980C80]
Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellIch möchte nur hinzufügen, dass der Grund, warum Sie in Ihrer ANOVA verlorene Freiheitsgrade sehen, meiner Meinung nach darin liegt, dass Sie sowohl rep als auch Batch als feste Effekte haben. Und diese beiden Effekte sind Alias. Es ist nicht möglich, ihre Auswirkungen zu trennen. Wenn Sie beide schätzen wollten, würde ich denken, dass beide zufällige Effekte sein sollten, wobei die Wiederholung im Stapel verschachtelt ist.Betreff: Randomisierter vollständiger Blockentwurf 2 x 2 faktoriellHallo Tegan,
Wenn ich das richtig verstehe – und es besteht jede Möglichkeit, dass ich es nicht verstehe! -
- Eine Wiederholung besteht aus 4 Ställen mit je 5 Tieren.
- Innerhalb jeder Wiederholung erhalten die 4 Stifte eine von vier verschiedenen Behandlungen gemäß der 2 x 2-Fakultät.
- Sie haben insgesamt 24 Wiederholungen,
- in zwei Chargen zu je 12 Stück.
- Also insgesamt 96 Stifte,
- was 96 Datenzeilen bedeutet.
Ich bin mir nicht sicher, warum rep als Effekt einbezogen werden muss. Rep scheint mir hier ein künstliches Konstrukt zu sein.
Gibt es einen Grund, einen systematischen Unterschied zwischen den Wiederholungen zu erwarten? Gibt es also einen Grund, warum alle Stifte innerhalb einer Wiederholung einen Effekt erfahren würden, der ihre Gesamtreaktion im Vergleich zu einer anderen Wiederholung verändern würde? Befindet sich jeder Vertreter in einem anderen Gebäude? Oder wurde jede Wiederholung zu einem anderen Zeitpunkt begonnen? Oder stammt jeder Vertreter aus einem anderen Elternstamm (ich weiß nicht, ob das in Ernährungsversuchen möglich ist, aber es fällt mir einfach schwer, mir mögliche Beispiele auszudenken!)?
Wenn es keinen Grund für einen systematischen Effekt von rep gibt, dann glaube ich nicht, dass er im Modell enthalten sein muss.
Wenn es im Modell enthalten sein sollte, dann sollte es meiner Meinung nach als Zufallseffekt vorhanden sein.
Ebenso sollte „Batch“ ein zufälliger Effekt sein.
Ein Grund für die Verwendung zufälliger Effekte besteht darin, dass sie weniger Freiheitsgrade beanspruchen.
Ich hoffe das hilft. Lassen Sie mich wissen, wenn ich etwas falsch verstanden habe oder Sie Fragen haben.
Phil