Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeCiao,
Sono nuovo in JMP quindi spero che tu possa aiutarmi!
Il mio esperimento era un disegno fattoriale randomizzato a blocchi 2 x 2 completo con due livelli di additivi supplementari. Un totale di 480 individui sono stati bloccati in recinti da 5 (il recinto funge da unità sperimentale, non da individuo) e i recinti all'interno di una replica sono stati assegnati a uno dei 4 trattamenti dietetici. Ho effettuato 24 repliche in totale, ma l'esperimento è stato condotto su due lotti, i primi 240 individui (12 ripetizioni) a febbraio e il secondo lotto di 240 individui (12 ripetizioni) ad aprile. Devo quindi contabilizzare il blocco del rappresentante e tenere conto del batch.
Voglio solo verificare che sto eseguendo correttamente l'ANOVA, nella casella "Costruisci effetti del modello" ho i miei due fattori, la loro interazione, Batch e rappresentante, è corretto? Tuttavia, quando lo faccio, questo batch perde il suo DF (come nella foto), quindi non sono sicuro di cosa fare?
Devo anche aggiungere una covariata per il peso iniziale per alcune analisi, anche questa va nella casella "Costruisci effetti del modello" o le covariate continue dovrebbero andare in un'altra casella?
Grazie!
Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeGiusto per completare la risposta, ecco come è possibile utilizzare il report per interpretare tale analisi.
• Le prime 3 parti del rapporto dovrebbero essere abbastanza familiari. Puoi vedere il significato degli effetti del trattamento fisso. Questa è la parte importante perché questi sono gli effetti che interessano. La maggior parte del resto del rapporto ti parla solo degli effetti casuali che riconosci come fonti di varianza ma di cui non ti interessa veramente.
• Le previsioni degli effetti casuali ti forniscono stime dell'effetto della differenza per ciascuna ripetizione
• I componenti della varianza REML ti diranno come la varianza viene attribuita ai tuoi effetti casuali (Rep e Batch in questo caso).
• Ci sono più dettagli sugli effetti più in basso.
• Puoi anche vedere le medie stimate della risposta per ciascun livello dei tuoi effetti casuali (Rep e Batch in questo caso).
Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeOk, penso di aver visto cosa è successo lì. Specificare gli effetti nidificati non è banale!
Penso che quello che hai lì sia Batch annidato in Rep - Batch[Rep]. Mentre vuoi che Rep sia nidificato all'interno di Batch - Rep[Batch]. Penso che dovresti avere anche Batch come effetto. E sia Rep[Batch] che Batch dovrebbero essere effetti casuali.
Nella documentazione di JMP è disponibile un esempio di modello a effetti casuali nidificati Qui . Proviene da un settore e da un'applicazione molto diversi, ma dovrebbe avere senso.
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Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeCiao Phil,
Mi scuso, spero che tu possa vederlo ora
Tegan
Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeCiò ha senso.
Non riesco a vedere l'immagine. Non penso che tu l'abbia allegato correttamente (purtroppo non puoi semplicemente incollare le immagini).Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeCiao Phil,
Grazie per la tua risposta.
Sì, è corretto, quindi ho 96 righe di dati.
Quindi la ripetizione deve essere inclusa perché gli individui sono stati assegnati in base al loro peso, quindi i recinti erano bilanciati all'interno della ripetizione, quindi, ad esempio, i 4 recinti nella ripetizione 1 che sono sottoposti a trattamenti diversi sono bilanciati per il loro peso, e lo stesso per la ripetizione 2 ecc. Quindi essenzialmente la ripetizione 1 potrebbe avere un peso medio più elevato rispetto alla ripetizione 2. Sono anche bilanciati per sesso e origine della lettiera all'interno della replica.
Quindi sembra che dovrei includerli come effetti casuali e ripetizioni annidate all'interno del batch. Vedi l'immagine allegata: cosa significa quando viene visualizzato un messaggio di errore che dice che non c'è intercettazione? (i pezzi scarabocchiati sono solo i miei due fattori e la loro interazione).
Grazie,
Tegan
[cid:image001.png@01D4BFA0.3B980C80]
Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeSolo per aggiungere che penso che il motivo per cui vedi gradi di libertà persi nel tuo ANOVA è perché hai sia rep che batch come effetti fissi. E questi 2 effetti sono con alias. Non è possibile separare i loro effetti. Se volessi stimarli entrambi, penserei che dovrebbero essere entrambi come effetti casuali con rep annidati all'interno del batch.Ri: Progettazione di blocchi completi randomizzati 2 x 2 fattorialeCiao Tegan,
Se ho capito bene, e ci sono tutte le possibilità che non lo capisca! -
- Una ripetizione è composta da 4 recinti di 5 animali.
- All'interno di ciascuna ripetizione le 4 penne hanno 1 dei 4 trattamenti diversi secondo il fattoriale 2 x 2.
- Hai 24 ripetizioni in totale,
- in due lotti da 12.
- Quindi 96 penne in totale,
- il che significa 96 righe di dati.
Non sono sicuro del motivo per cui la rep debba essere inclusa come effetto. Rep mi sembra un costrutto artificiale qui.
C'è qualche motivo per aspettarsi una differenza sistematica tra le ripetizioni. Cioè qualche ragione per cui tutte le penne all'interno di una ripetizione sperimenterebbero qualche effetto che cambierebbe la loro risposta complessiva rispetto a un'altra ripetizione? Ogni rappresentante si trova in un edificio diverso? Oppure ogni ripetizione è stata avviata in un momento diverso? Oppure ogni rappresentante proviene da un ceppo genitore diverso (non so se ciò sia possibile nelle prove nutrizionali, ma mi sto stancando di pensare a possibili esempi!)?
Se non vi è alcuna ragione per un effetto sistematico della ripetizione, allora non penso che sia necessario inserirlo nel modello.
Se dovesse essere nel modello, allora penserei che dovrebbe essere lì come effetto casuale.
Allo stesso modo "batch" dovrebbe essere un effetto casuale.
Uno dei motivi per utilizzare gli effetti casuali è che consumano meno gradi di libertà.
Spero che aiuti. Fammi sapere se ho capito qualcosa di sbagliato o se hai domande.
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