Conception de blocs complets randomisés Factorielle 2 x 2Salut,
Je suis nouveau sur JMP, j'espère donc que vous pourrez m'aider !
Mon expérience était un plan factoriel en blocs complets randomisés 2 x 2 avec deux niveaux d'additifs supplémentaires. Au total, 480 individus ont été répartis dans des enclos de 5 (l'enclos fait office d'unité expérimentale et non d'individu), et les enclos d'une répétition ont été affectés à l'un des 4 traitements diététiques. J'ai eu 24 répétitions au total, mais l'expérience a été menée sur deux lots, le premier 240 individus (12 répétitions) en février et le deuxième lot de 240 individus (12 répétitions) en avril. Je dois donc comptabiliser le bloc pour le représentant et comptabiliser le lot.
Je veux juste vérifier que je fais l'ANOVA correctement, dans la case « Construire les effets du modèle » j'ai mes deux facteurs, leur interaction, Batch et rep, est-ce correct ? Cependant, lorsque je le fais, ce lot perd son DF (comme sur la photo), donc je ne sais pas quoi faire ?
Je dois également ajouter une covariable pour le poids de départ pour une partie de l'analyse, est-ce que cela va également dans la case « Construire les effets du modèle » ou les covariables continues doivent-elles aller dans une autre case ?
Merci!
Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2Juste pour compléter la réponse, voici comment vous pouvez ensuite utiliser le rapport pour interpréter cette analyse.
• Les trois premières parties du rapport devraient être assez familières. Vous pouvez voir l’importance des effets fixes de votre traitement. C’est l’élément important car ce sont les effets qui nous intéressent. La majeure partie du reste du rapport ne fait que vous parler des effets aléatoires que vous reconnaissez comme des sources de variance mais dont vous ne vous souciez pas vraiment.
• Les prédictions d'effets aléatoires vous donnent des estimations de l'effet de la différence pour chaque répétition
• Les composants de variance REML vous indiqueront comment la variance est attribuée à vos effets aléatoires (Rep et Batch dans ce cas).
• Il y a plus de détails sur les effets plus bas.
• Vous pouvez également voir les moyennes estimées de la réponse pour chaque niveau de vos effets aléatoires (Rep et Batch dans ce cas).
Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2D'accord, je pense que je vois ce qui s'est passé là-bas. Spécifier des effets imbriqués n’est pas anodin !
Je pense que ce que vous avez là est Batch imbriqué dans Rep - Batch[Rep]. Alors que vous voulez que Rep soit imbriqué dans Batch - Rep[Batch]. Je pense que vous devriez également avoir Batch comme effet. Et Rep[Batch] et Batch devraient être des effets aléatoires.
Il existe un exemple de modèle d'effets aléatoires imbriqué dans la documentation JMP. ici . Il s’agit d’une industrie et d’une application très différentes, mais cela devrait avoir du sens.
Phil
Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2Salut Phil,
Toutes mes excuses, j'espère que vous pourrez le voir maintenant
Tégan
Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2Ça a du sens.
Je ne peux pas voir l'image. Je ne pense pas que vous l'ayez joint correctement (malheureusement, vous ne pouvez pas simplement coller des images).Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2Salut Phil,
Merci pour votre réponse.
Oui, c'est exact, j'ai donc 96 lignes de données.
La répétition doit donc être incluse car les individus ont été répartis en fonction de leur poids, donc les stylos étaient équilibrés au sein de la répétition, ainsi par exemple, les 4 stylos de la répétition 1 qui sont sur des traitements différents sont équilibrés pour leur poids, et pareil pour la répétition 2. etc. Donc, essentiellement, la répétition 1 pourrait avoir un poids moyen plus élevé que la répétition 2. Ils sont également équilibrés en termes de sexe et d’origine de la portée au sein de la répétition.
Il semble donc que je doive les inclure sous forme d'effets aléatoires et de répétitions imbriquées dans un lot. Veuillez consulter l'image ci-jointe. Qu'est-ce que cela signifie lorsqu'un message d'erreur apparaît indiquant qu'il n'y a pas d'interception ? (les morceaux griffonnés ne sont que mes deux facteurs et leur interaction).
Merci,
Tégan
[cid:image001.png@01D4BFA0.3B980C80]
Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2Juste pour ajouter que je pense que la raison pour laquelle vous constatez une perte de degrés de liberté dans votre ANOVA est que vous avez à la fois des répétitions et des lots comme effets fixes. Et ces 2 effets sont alias. Il n'est pas possible de séparer leurs effets. Si vous vouliez estimer les deux, je pense qu'ils devraient être tous deux des effets aléatoires avec une répétition imbriquée dans le lot.Re : Conception de blocs complets randomisés factoriel 2 x 2Salut Tegan,
Si j'ai bien compris - et il y a de fortes chances que ce ne soit pas le cas ! -
- Un représentant correspond à 4 enclos de 5 animaux.
- Au sein de chaque répétition, les 4 stylos ont 1 des 4 traitements différents selon la factorielle 2 x 2.
- Vous avez 24 répétitions au total,
- en deux lots de 12.
- Donc 96 stylos au total,
- ce qui signifie 96 lignes de données.
Je ne sais pas pourquoi la représentation doit être incluse comme effet. Rep me semble ici être une construction artificielle.
Y a-t-il une raison de s'attendre à une différence systématique entre les répétitions. C'est-à-dire une raison pour laquelle tous les stylos d'un représentant subiraient un effet qui modifierait leur réponse globale par rapport à un autre représentant ? Chaque représentant se trouve-t-il dans un bâtiment différent ? Ou chaque répétition a-t-elle commencé à un moment différent ? Ou chaque représentant provient d'une souche parentale différente (je ne sais pas si cela est possible dans les essais nutritionnels mais j'essaie juste de penser à des exemples possibles !) ?
S'il n'y a aucune raison pour un effet systématique de répétition, je ne pense pas que cela doive figurer dans le modèle.
Si cela devait figurer dans le modèle, je pense que cela devrait être un effet aléatoire.
De même, le « lot » devrait être un effet aléatoire.
L’une des raisons pour lesquelles on utilise des effets aléatoires est qu’ils consomment moins de degrés de liberté.
J'espère que cela aide. Faites-moi savoir si j'ai quelque chose de mal dans ma compréhension ou si vous avez des questions.
Phil
