隨機完全區組設計 2 x 2 階乘你好呀，
我是 JMP 的新手，希望您能提供協助！
我的實驗是隨機完全區組 2 x 2 析因設計，具有兩個水平的補充添加劑。 總共 480 隻個體被分成 5 個圍欄（圍欄作為實驗單位，而不是個體），並且重複中的圍欄被分配到 4 種飲食治療中的一種。 我總共進行了 24 次重複，但實驗分兩批進行，第一批 240 人（12 次重複）在 2 月進行，第二批 240 人（12 次重複）在 4 月進行。 因此，我需要考慮代表的區塊和批次的情況。
我只是想檢查我是否正確進行了方差分析，在“構建模型效應”框中，我有兩個因素，它們的相互作用，批次和代表，這是正確的嗎？ 但是，當我執行此批次時，它會丟失 DF（如圖所示），所以我不知道該怎麼辦？
我還需要為某些分析添加起始權重的協變量，這是否也放入“構建模型效應”框中，或者連續協變量是否應該放入另一個框中？
謝謝！
回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘為了完成答案，您可以使用該報告來解釋該分析。
• 報告的前 3 部分應該相當熟悉。 你可以看到你的固定治療效果的意義。 這是重要的一點，因為這些是我們感興趣的效果。 報告的其餘大部分內容只是告訴您隨機效應，您認為這些隨機效應是變異數的來源，但並不真正關心。
• 隨機效應預測為您提供每個代表的差異影響的估計
• REML 變異數分量將告訴您變異數如何歸因於隨機效應（在本例中為「重複」和「批次」）。
• 下面有更多效果細節。
• 您也可以查看隨機效應每個等級（在本例中為「重複」和「批次」）的反應的估計平均值。
回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘好吧，我想我明白那裡發生了什麼。 指定嵌套效果並不簡單！
我認為您擁有的是嵌套在 Rep - Batch[Rep] 中的 Batch。 而您希望 Rep 嵌套在 Batch - Rep[Batch] 中。 我認為你還應該有批次作為效果。 Rep[Batch] 和 Batch 都應該是隨機效果。
JMP 文件中有一個嵌套隨機效應模型的範例這裡。 它來自一個非常不同的行業和應用，但應該有意義。
菲爾
回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘嗨菲爾，
抱歉希望你現在能看到
泰根
回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘這就說得通了。
我看不到圖像。 我認為您沒有正確附加它（不幸的是您不能只貼上圖像）。回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘嗨菲爾，
感謝您的回覆。
是的，這是正確的，所以我有 96 行資料。
因此需要包括代表，因為個體是根據體重分配的，因此代表內的筆是平衡的，因此，例如，代表 1 中接受不同處理的 4 只筆的體重是平衡的，代表 2 也是如此等等。所以基本上代表1 的平均重量可能比代表2 更高。 它們在複製內也平衡了性別和窩來源。
所以聽起來好像我需要將它們作為隨機效果和嵌套在批次中的代表包含在內。 請參閱附圖 - 當出現一條錯誤訊息說沒有攔截時，這意味著什麼？ （潦草的部分只是我的兩個因素及其交互作用）。
謝謝，
泰根
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回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘只是補充一點，我認為您在方差分析中看到失去自由度的原因是因為您同時將代表和批次作為固定效應。 這兩種效果是混疊的。 不可能將它們的影響分開。 如果你想估計兩者，那麼我認為它們應該都是隨機效應，並且代表嵌套在批次中。回覆：隨機完整分塊設計 2 x 2 階乘嗨，泰根，
如果我理解正確的話——但我很可能沒有理解！ -
- 一個代表是 4 個圍欄，每欄 5 隻動物。
- 在每個代表中，4 支筆根據 2 x 2 階乘進行 4 種不同處理中的一種。
- 你總共有 24 次代表，
- 分兩批，每批12個。
- 所以總共96支筆，
- 這意味著 96 行資料。
我不確定為什麼需要將代表作為效果包含在內。 在我看來，代表在這裡似乎是一個人造的東西。
是否有任何理由預期代表之間存在系統性差異。 即，為什麼代表中的所有筆都會經歷某種影響，從而改變其相對於另一個代表的整體響應？ 每個代表都在不同的建築物內嗎？ 還是每個代表是在不同的時間點開始的？ 或者每個代表都來自不同的親代（不知道這在營養試驗中是否可能，但我只是在努力思考可能的例子！）？
如果沒有理由出現代表的系統效應，那麼我認為它不需要出現在模型中。
如果它應該存在於模型中，那麼我認為它應該作為隨機效應存在於其中。
同樣，「批次」應該是隨機效應。
使用隨機效應的原因之一是它們消耗較少的自由度。
我希望這有幫助。 如果我的理解有誤或您有疑問，請告訴我。
菲爾
