Diseño personalizado para CFU / mLHola,
Estoy intentando configurar mi DOE pero parece que no puedo generar el diseño correcto. Aquí está mi experimento: tres pruebas (realizadas en tres días separados), 9 tratamientos (GH, GM, GL, SH, SM, SL, MH, MM, ML) que se probarán con 4 soluciones de rehidratación (NaCl, peptona, PBS). , Maltosa). Habrá dos factores de dilución (1: 1, 1:10), 3 placas por factor de dilución (1, 2, 3) y 0,1 ml de volumen plateado. Registraré las colonias y usaré la fórmula: Colonias x Factor de dilución / volumen. En este momento, tengo el diseño personalizado configurado en base al archivo adjunto. Como puede ver, tengo que agregar las columnas de factor de dilución, volumen total y colonias en el diseño generado. No solo eso, sino que cuando reorganicé / agrupé la rehidratación / tratamiento, noté que mi diseño no genera suficientes filas para dos factores de dilución (por ejemplo, la maltosa GH). ¡Cualquier ayuda sería genial, gracias!
Re: Diseño personalizado para CFU / mLEl primer problema es la definición "Número de ejecuciones de replicación" en la herramienta de diseño personalizado.
Cuando configura esa opción en 3, obtiene un total de tres ejecuciones replicadas. Si el número mínimo de ejecuciones para su experimento era 12 y coloca un "3" en el cuadro "Número de ejecuciones de réplica", obtendría 15 ejecuciones como el nuevo mínimo, no 36. (que es lo que sucedería en algunos de los diseños clásicos). Claramente, un lugar donde la confusión puede ocurrir.
Un segundo problema tiene que ver con las placas replicadas y la unidad experimental. Cada combinación de tratamiento y solución es una unidad experimental. La unidad experimental está diluida o no (1:10 o 1: 1), y luego la unidad se coloca (mide) tres veces. Las tres placas no son réplicas en el diseño; sin embargo, la media de las tres placas representa la unidad experimental. También supondría que en el análisis solo se pueden usar recuentos de dilución bajos, a menos que sea TNTC o, de lo contrario, se usaría la dilución más alta.
Debido a que desea realizar todas las combinaciones de factores, el diseñador de custodia le construye un diseño factorial completo de 36 ejecuciones. Las interacciones pueden estimarse en este diseño, por lo que agregar interacciones en el diseñador personalizado solo agrega otras 36 ejecuciones.
Cada día puede configurar las 36 combinaciones de soluciones de tratamiento. Luego haga sus dos diluciones, y la placa cada dilución 3 veces. Hacer 216 platos en un día no es irrazonable, suena divertido. Me uniría a ti pero ... Creo que tengo algo en marcha ese día.
Re: Diseño personalizado para CFU / mLSegún su descripción, parece que necesitaría incluir factores adicionales en su diseño. Si su intención es 3 placas para cada factor de dilución, solución de tratamiento, combinación de tratamiento para cada día, tal vez el factor de bloqueo del día y el factor de dilución deben incluirse en el modelo. Por favor, vea la captura de pantalla adjunta. Al configurar el factor de bloqueo, especifiqué 216 ejecuciones por bloque. Tenga en cuenta las 72 ejecuciones de repetición que deben permitir cada combinación tres veces al día.
