Kundenspezifisches Design für CFU / mLHallo,
Ich versuche, mein DOE einzurichten, kann aber nicht das richtige Design generieren. Hier ist mein Experiment: Drei Trails (an drei verschiedenen Tagen durchgeführt), 9 Behandlungen (GH, GM, GL, SH, SM, SL, MH, MM, ML), die mit 4 Rehydrationslösungen (NaCl, Pepton, PBS) getestet werden , Maltose). Es gibt zwei Verdünnungsfaktoren (1: 1, 1:10), 3 Platten pro Verdünnungsfaktor (1, 2, 3) und ein Volumen von 0,1 ml. Ich werde die Kolonien aufnehmen und die Formel verwenden: Kolonien x Verdünnungsfaktor / Volumen. Im Moment habe ich das benutzerdefinierte Design basierend auf der angehängten Datei eingerichtet. Wie Sie sehen können, muss ich den Verdünnungsfaktor, das Gesamtvolumen und die Kolonien in das generierte Design einfügen. Nicht nur das, aber als ich die Rehydratisierung / Behandlung neu organisierte / gruppierte, fiel mir auf, dass nicht genügend Reihen von meinem Design für zwei Verdünnungsfaktoren erzeugt wurden (Beispiel Maltose GH). Jede Hilfe wäre super danke!
Betreff: Custom Design für CFU / mLDas erste Problem ist die Definition "Anzahl der Replikationsdurchläufe" im benutzerdefinierten Entwurfstool.
Wenn Sie diese Option auf 3 setzen, erhalten Sie insgesamt drei replizierte Läufe. Wenn die Mindestanzahl von Läufen für Ihr Experiment 12 war und Sie eine "3" in das Feld "Anzahl der replizierten Läufe" eingeben, erhalten Sie 15 Läufe als neues Minimum und nicht 36. (Dies ist, was in einigen der klassischen Designs passieren würde.) Ein Ort, an dem Verwirrung auftreten kann
Ein zweiter Punkt betrifft die Replikatplatten und die experimentelle Einheit. Jede Kombination von Behandlung und Lösung ist eine experimentelle Einheit. Die experimentelle Einheit wird verdünnt oder nicht (1:10 oder 1: 1), und dann wird die Einheit dreimal plattiert (gemessen). Die drei Platten sind nicht im Design nachgebildet; Der Mittelwert der drei Platten repräsentiert jedoch die experimentelle Einheit. Ich würde auch annehmen, dass man in der Analyse nur niedrige Verdünnungszahlen verwenden könnte, es sei denn, es handelt sich um TNTC. Andernfalls würde die höhere Verdünnung verwendet werden.
Da Sie alle Faktorkombinationen ausführen möchten, erstellt der Designer einen 36-fachen faktoriellen Entwurf. Die Interaktionen können in diesem Design geschätzt werden. Das Hinzufügen von Interaktionen im benutzerdefinierten Designer fügt lediglich 36 weitere Läufe hinzu.
An jedem Tag können Sie die 36 Verbindungen der Behandlungslösung einstellen. Dann machen Sie Ihre zwei Verdünnungen und die Platte jede Verdünnung dreimal. 216 Platten an einem Tag zu machen ist nicht unvernünftig, klingt nach Spaß. Ich würde mich dir anschließen, aber ... Ich glaube, ich habe an diesem Tag etwas zu tun.
Betreff: Custom Design für CFU / mLAufgrund Ihrer Beschreibung scheint es, als müssten Sie zusätzliche Faktoren in Ihr Design einbeziehen. Wenn Sie 3 Platten für jeden Verdünnungsfaktor, Rehydratisierungslösung, Behandlungskombination für jeden Tag, vielleicht einen Blockierungsfaktor für den Tag und den Verdünnungsfaktor in das Modell einbeziehen möchten. Bitte sehen Sie den Screenshot im Anhang. Beim Einrichten des Blockierungsfaktors habe ich 216 Läufe pro Block angegeben. Beachten Sie die 72 Replikatläufe, die für jede Kombination dreimal täglich gelten sollten.
