Conception personnalisée pour CFU / mLBonjour,
J'essaie de configurer mon DOE mais n'arrive pas à générer le bon design. Voici mon expérience: Trois pistes (effectuées sur trois jours distincts), 9 traitements (GH, GM, GL, SH, SM, SL, MH, MM, ML) qui seront testés avec 4 solutions de réhydratation (NaCl, Peptone, PBS) , Maltose). Il y aura deux facteurs de dilution (1: 1, 1:10), 3 plaques par facteur de dilution (1, 2, 3) et un volume plaqué de 0,1 ml. Je vais enregistrer les colonies et utiliser la formule suivante: Colonies x Facteur de dilution / volume. À l'heure actuelle, j'ai la conception personnalisée mis en place en fonction du fichier joint. Comme vous pouvez le constater, je dois ajouter les colonnes facteur de dilution, volume total et colonies au plan généré. Non seulement cela, mais quand j'ai réorganisé / groupé la réhydratation / traitement, j'ai remarqué qu'il n'y avait pas assez de lignes générées par ma conception pour deux facteurs de dilution (exemple Maltose GH). Toute aide serait super merci!
Re: Conception personnalisée pour CFU / mLLe premier problème est la définition «Nombre de réplications exécutées» dans l'outil de conception personnalisée.
Lorsque vous définissez cette option sur 3, vous obtenez un total de trois exécutions répliquées. Si le nombre minimum de cycles pour votre test était de 12 et que vous avez mis un "3" dans la case "Nombre de cycles de réplication", vous obtiendrez alors 15 cycles comme nouveau minimum, et non 36. (ce qui se produirait dans certaines des conceptions classiques.) Clairement un endroit où la confusion peut se produire
Un deuxième problème concerne les plaques répliquées et l'unité expérimentale. Chaque combinaison de traitement et de solution constitue une unité expérimentale. L'unité expérimentale est diluée ou non (1:10 ou 1: 1), puis l'unité est étalée (mesurée) trois fois. Les trois plaques ne sont pas répliquées dans la conception; Cependant, la moyenne des trois plaques représente l'unité expérimentale. Je suppose également que, dans l’analyse, on ne pourrait utiliser que des décomptes de faible dilution, sauf s’il s’agit de TNTC; sinon, la dilution la plus élevée serait utilisée.
Parce que vous voulez effectuer toutes les combinaisons de facteurs, custome Designer vous construit un plan factoriel complet en 36 exécutions. Les interactions peuvent être estimées, dans cette conception, de sorte que l'ajout d'interactions dans le concepteur personnalisé ajoute simplement 36 autres exécutions.
Chaque jour, vous pouvez configurer les 36 combinaisons de solution de traitement. Ensuite, faites vos deux dilutions, et la plaque chaque dilution 3 fois. Faire 216 assiettes par jour n'est pas déraisonnable, ça a l'air amusant. Je te rejoindrais mais ... Je pense que quelque chose se passe ce jour-là.
Re: Conception personnalisée pour CFU / mLSelon votre description, il semble que vous deviez inclure des facteurs supplémentaires dans votre conception. Si votre intention est de 3 plaques pour chaque facteur de dilution, solution de réhydratation, combinaison de traitement pour chaque jour, peut-être un facteur de blocage du jour et le facteur de dilution doivent être inclus dans le modèle. S'il vous plaît voir la capture d'écran ci-jointe. Lors de la configuration du facteur de blocage, j'ai spécifié 216 cycles par bloc. Notez les 72 répétitions qui devraient permettre chaque combinaison trois fois par jour.
