CFU / mL的定制設計你好,
我正在嘗試設置我的DOE,但似乎無法生成正確的設計。這是我的實驗:三個試驗(分三天進行),9個處理(GH,GM,GL,SH,SM,SL,MH,MM,ML),將用4種補液(NaCl,蛋白腖,PBS)進行測試,麥芽糖)。將有兩個稀釋因子(1:1,1:10),每稀釋因子3個板(1,2,3)和0.1ml體積的電鍍。我將記錄菌落並使用公式:菌落x稀釋因子/體積。現在,我根據附件設置了自定義設計。如您所見,我必須在生成的設計中添加稀釋係數,總體積和菌落列。不僅如此,當我重新組織/分組補液/處理時,我注意到我的設計沒有足夠的行產生兩種稀釋因子(例如麥芽糖GH)。任何幫助都會非常感謝!
回复:CFU / mL的定制設計第一個問題是“自定義設計”工具中的“複製運行次數”的定義。
將該選項設置為3時,總共可以獲得三次復制運行。如果您的實驗的最小運行次數為12,並且您在“重複運行次數”框中輸入“3”,那麼您將獲得15次運行作為新的最小值,而不是36次。 (這是一些經典設計會發生的事情。)顯然是一個可能發生混亂的地方
第二個問題與復制板和實驗單元有關。治療和解決方案的每個組合是一個實驗單位。將實驗單元稀釋或不稀釋(1:10或1:1),然後將單元電鍍(測量)三次。 這三塊板在設計中沒有重複;然而,三個平板的平均值確實代表了實驗單位。 我還假設在分析中,人們可能只使用低稀釋計數,除非它是TNTC,否則將使用更高的稀釋度。
因為您想要執行所有因子組合,所以客戶設計師會為您構建36運行全因子設計。在此設計中,可以估計交互,因此在自定義設計器中添加交互只會添加另外36次運行。
在每一天,您可以設置36個治療解決方案的組合。然後做兩次稀釋,每次稀釋3次。一天做216塊盤子並非不合理,聽起來很有趣。我會加入你但是...... 我想那天我發生了什麼。
回复:CFU / mL的定制設計根據您的描述,您似乎需要在設計中包含其他因素。如果您打算每個稀釋因子使用3個平板,則每天更換溶液,處理組合,可能需要一天的阻塞因子和稀釋因子。請參閱隨附的屏幕截圖。設置阻塞因子時,我為每個塊指定了216次運行。注意72次重複運行,每天應該允許每個組合三次。