시간 경과에 따른 96웰 추적안녕하세요,
저는 96웰 플레이트에 시간 경과에 따른 OD를 기록하는 동역학 분석기를 가지고 있습니다.
출력은 OD이고 각 OD 값에 대한 시간과 위치(A1, A2 등)가 포함된 데이터 열이 있습니다.
맵 모양을 적용하면 Graph Builder에서 특정 시간(예: 0시간 또는 1시간)에 96웰 플레이트를 시각화할 수 있습니다.
Graph Builder 또는 다른 SAS JMP 기능을 사용하여 동일한 플레이트에서 시간에 따른 OD의 변화를 표시할 수 있습니까(Bubble Plot 기능과 유사)?
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적그동안 100개 우물에 대한 형상과 테스트 파일을 만들었습니다. 모양 파일이나 테스트 파일에서 중앙 우물 4개를 제거하는 데 시간이 걸리지 않았습니다. 그것은 나를 위해 작동합니다.
파일을 함께 저장하거나 두 개의 모양 정의 파일을 사용 중인 JMP 버전에 대해 문서화된 공통 모양 폴더로 이동하십시오.
생성한 셰이프 파일에 확실히 뭔가 문제가 있는 것 같은데 그게 뭔지 알 수 없습니다.
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적나는 무엇이 잘못되었는지 모른다.
96웰 예제가 작동하는지 확인했습니다. 그런 다음 귀하의 파일을 조사한 결과 올바르게 정의되어 있음을 발견했지만 귀하와 동일한 문제가 있었습니다. 이름 및 XY 정보에 대한 새 데이터 테이블을 만들고 데이터 값을 내 테이블에 복사하고 열 속성을 추가했습니다. 동일한 테스트 폴더에 있는 모든 파일을 사용하여 테스트했지만 아무 도움이 되지 않았습니다. 문제는 데이터가 아니라 모양 파일 중 하나입니다.
추가 도움이 필요하면 JMP 기술 지원팀에 문의하시기 바랍니다. ( support@jmp.com )
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적예, 응답 변수를 가운데로 드래그하려고 했지만 여전히 "위치에 대한 모양 파일을 찾을 수 없습니다"라는 오류 메시지와 함께 빈 그래프가 표시됩니다.
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적그렇다면 10x10 플레이트 레이아웃에 대한 모양 파일을 직접 만드셨나요? 여기에 설명된 단계를 따랐습니까? 블로그 게시물 ?
그러면 Graph Builder에 새 모양을 추가할 수 있지만 응답 데이터(Y)가 표시되지 않습니까? 응답 데이터가 있는 데이터 열을 그래프 빌더 중앙으로 끌어오셨나요? 위에 언급된 블로그 게시물에 설명된 단계를 수행하셨나요?
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적안녕 마크,
내 플레이트 디자인에 따라 96웰 플레이트 디자인을 변경하려고 했습니다. 10*10이고 가운데 4개의 웰이 비어 있었습니다. 하지만 내 출력에는 빈 그래프가 표시됩니다.여러 변수에 대한 히트맵을 생성하기 위해 이 그래프를 사용할 수 있습니까?
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적미세역가 플레이트 웰의 모양 파일은 다음에서 찾을 수 있습니다. 여기 JMP 커뮤니티의 JMP 파일 교환 영역에 있습니다.
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적그렇군요, 감사합니다!
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적나는 그들을 그리지 않았다. JMP는 96웰 및 384웰 형식의 JMP 파일을 개발했습니다. 그런 다음 열 속성의 맵 역할 아래에 추가할 수 있습니다.
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적효과가 있어서 기뻐요. 도형에 원을 어떻게 그렸나요? 멋지네요!Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적당신의 답변에 감사드립니다.
내 케이스에 스크립트를 다시 작성하고 Shape 아래에 웰을 추가하는 것은 쉬웠습니다.
아래 출력을 추가했습니다.
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적JMP는 이런 종류의 데이터를 이용해 꽤 놀라운 일을 해낼 수 있습니다. (당신이 이미 무엇을 알고 있는지 잘 모르겠습니다. 따라서 이 중 일부는 약간 기본적일 수 있으며, 누가 이 내용을 읽을지 알 수 있습니다.)
올바른 형식으로 가져오는 첫 번째 단계입니다. Excel 사고방식으로 볼 때 이는 매우 어려운 일이지만 JMP의 표 도구를 사용하면 이 작업이 쉬워집니다. 우리에게 필요한 것은 시간 열 하나, OD 열 하나, 위치 열 하나입니다. (또한 접시에 치료의 복제물이 있을 수 있지만 이는 좀 더 복잡해지기 때문에 간단한 경우로 진행하겠습니다. 그런 경우에는 처리 반복의 평균을 얻고 싶을 수 있으며, 이 경우 위치 열이 없고 처리 열이 있게 됩니다.)
- 모든 위치를 한 곳에 모으려면 Tables>Stack으로 이동하여 OD 데이터가 있는 모든 열을 쌓고 다른 열은 선택하지 마세요.
-이렇게 하면 시간 열 하나, OD 값이 있는 열 하나, 위치 ID가 있는 열 하나가 생성됩니다. (OD 값 "OD600" 또는 적절한 이름으로 열 이름을 바꿉니다.
첫 번째 그래프: 그래프 빌더를 사용하여 X축에 시간을, Y축에 OD를 배치합니다. 성장 중인 항목에 따라 대략 S자 모양의 데이터 포인트 클라우드가 표시됩니다. 마지막으로 오버레이 역할에 위치 변수를 추가합니다. 그래프 요소에서 데이터 포인트와 매끄러운 선 또는 연결된 선을 켭니다.
버블 플롯: X는 시간, 시간은 시간, Y는 OD, ID는 위치입니다. 이 그래프를 실행하고 재생 버튼을 클릭하고 가장 고통스러운 시계열 그래프가 눈앞에 나타나는 것을 지켜보세요. 다시는 이런 일을 하지 않거나 존경하는 동료들에게 시청하게 하세요. IMHO, 시간 변수는 X 축 변수와 시간 역할에 동시에 사용되어서는 안됩니다. 이것은 그래픽적인 죄이자 혐오스러운 것입니다(다시 말하지만, 내 겸손한 의견으로는 강력할 수 있습니다.) pH, O2, CO2, NH4, 가장 좋아하는 탄소원, Gln, Glu 또는 기타 대사물을 측정했다면 X축과 Y축의 비율과 시간 역할에 시간 변수를 사용하는 것은 흥미로운 그래프가 될 것 같습니다. 버블 도표는 시간에 따른 그룹 및 개인 변수 간의 관계를 살펴보는 데 유용합니다.
실제 그래프: 분석>특화 모델링>맞춤 곡선. X에는 시간을, Y에는 DO를, ID/그룹 역할에는 위치를 입력합니다. 핫스팟으로 이동하여 데이터에 맞는 모델을 선택해 보세요. (시그모이드>로지스틱> 4p 및 5p 옵션 시도) JMP는 모든 성장 곡선에 적합하며 모수 추정치 표를 제공합니다.
이것이 조금 도움이 되기를 바랍니다. 이것은 일반적으로 작업하기에 매우 재미있는 데이터이므로 결국 멋진 인물을 만들면 가능하면 이미지를 게시하십시오.
건배,
-비
참고: JMP 14에는 이 경우에 더 많은 작업을 수행할 수 있는 새로운 도구가 있지만, 출시되면 이 도구도 다룰 것이라고 확신합니다.
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적Ian의 답변을 확장하려면 그래프에 로컬 데이터 필터를 추가하고 개별 샘플 시간을 보려면 시간 축을 순서로 변경한 다음 데이터 필터 아래에서 애니메이션을 사용할 수 있습니다. 아래 스크립트를 실행하는 경우 왼쪽 상단에서 재생을 누르면 됩니다.
Names default to here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Time Series/Air.jmp" );
Column( dt, "date" ) << Set Modeling Type( "Ordinal" );
graph = dt << Graph Builder(
Size( 516, 680 ),
Show Control Panel( 0 ),
Variables( Y( :Ozone Concentration ) ),
Elements( Bar( Y, Legend( 3 ) ) ),
Local Data Filter(
Add Filter(
columns( :date ),
Where( :date == 1953936000 ),
Display( :date, Size( 256, 360 ), List Display )
),
Animation( Animate Column( :date ), Animate Rate( 90 ) )
),
SendToReport(
Dispatch(
{},
"Ozone Concentration",
ScaleBox,
{Format( "Best", 9 ), Min( 0 ), Max( 10 ), Inc( 2 ), Minor Ticks( 1 )}
)
)
);
Re: 시간 경과에 따른 96웰 추적그래프 빌더를 원하는 방식으로 표시한 다음 '시간' 변수를 로컬 데이터 필터.
