ANOVA - codage et structuration des donnéesSalut,
J'ai deux questions concernant l'exécution d'une ANOVA dans JMP. J'ai mené une expérience avec trois facteurs, chacun comportant deux niveaux. Dites Facteur A, Facteur B, Facteur C. Et puis pour chacun – soit le niveau « élevé », soit le niveau « bas ». Cela me donne un total de 8 groupes de traitement. J'ai également inclus un groupe témoin qui n'a reçu aucun de ces traitements.
Ainsi, un exemple est que les participants du groupe no. 1 ne recevrait aucun traitement (contrôle), les participants du groupe 2 recevraient ce traitement : Facteur A = faible, Facteur = B, faible, Facteur = C élevé, et les participants du groupe 3 recevraient ce traitement : Facteur A = élevé, Facteur = B, faible, Facteur = C élevé, etc.
Mes hypothèses sont actuellement du type suivant :
1) Mieux vaut traiter que contrôler
2) Pour le facteur A, mieux vaut être élevé que faible
3) Pour le facteur B, mieux vaut être élevé que faible
4) Pour le facteur A, mieux vaut être élevé que faible
1) Ma première question concerne le codage des données. j'ai lu ce post https://www.jmp.com/support/help/14/coding-for-nominal-effects.shtml#1047389
- ce qui me donne l'impression que je devrais coder mes traitements comme -1, 0 et 1 pour que JMP puisse exécuter l'ANOVA. Est-ce exact? Actuellement, j'ai une colonne pour chaque facteur dans laquelle j'ai utilisé les nombres 0,1,2 pour désigner « contrôle », « faible », « élevé ». Mais dois-je recoder cela en -1 (contrôle), 0 (faible), 1 (élevé) ???
2) Ma prochaine question est de savoir comment j'inclue pratiquement le groupe témoin dans l'ANOVA. Doit-il être inclus comme un « niveau » de chacun des trois facteurs ou comme un facteur distinct ? Si oui, quels sont les niveaux d’un tel facteur de « contrôle » ? Actuellement, j'ai codé les données afin que la condition de contrôle soit incluse comme niveau pour chacun des trois facteurs. Mais JMP ne semble pas aimer ça (je reçois beaucoup de texte étrange en sortie) - peut-être est-ce dû au codage 0,1,2 actuel ? Ou faut-il inclure le groupe témoin comme quatrième facteur ? Si tel est le cas, cette colonne devrait-elle alors être codée comme contrôle ou non-contrôle ? Ou en tant que groupe numéro 1 à 9 ? J'espère que cela a du sens!
J'apprécierais grandement toute contribution ici ! 
/Katrine
Re: ANOVA - codage et structuration des données- Nous avons donc un modèle et les tests d’effets sont effectués !
- Oui, c'est ce que suggère mon collègue. La suggestion était de satisfaire votre demande de comparaison avec un groupe témoin. Vous pouvez utiliser l'ANOVA et la procédure de comparaison multiple ultérieure (Dunnet) pour étudier les différences significatives. Vous testez les interactions, tous les effets en fait, mais pas explicitement.
Au départ, je pensais que l'ordre des valeurs pourrait être utile en raison de la manière dont JMP code en interne les niveaux de facteurs. Cela n'aide pas vraiment, je suppose.
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesRe-bonjour
Merci. Juste pour être sûr d'avoir bien compris :
Je devrais:
1) Exécutez l’ANOVA avec les trois facteurs, mais excluez le groupe témoin.Ça marche.Le modèle ne montre aucune différence significative entre les trois traitements (comme prévu sur la base de mon analyse préliminaire). Il ne montre pas non plus d’effets d’interaction significatifs.
2) Exécutez une ANOVA unidirectionnelle avec un facteur. En termes pratiques, j'utilise la colonne de l'ensemble de données où j'ai le numéro de groupe (1-9) et j'utilise essentiellement ces groupes de traitement comme variables indépendantes. Est-ce ce que suggère votre collègue? Cela fonctionne, mais de cette façon, je suppose que je ne peux pas vérifier les effets d'interaction...Et pourquoi faire cette analyse si la première n’a révélé aucune différence significative ?
À votre dernier commentaire sur l'ordre des valeurs : j'ai ordonné les niveaux mais je ne comprends pas vraiment quelle différence, le cas échéant, cela fait pour les résultats. Je ne vois une différence que dans le rendu visuel... Mais peut-être que je devrais m'arrêter ici !
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesNe t'excuse pas. Certaines questions ou problèmes nécessitent un certain temps pour être compris et résolus.
Oui, merci pour la précision. Vous devrez séparer la partie estimation/modélisation de la partie test de votre analyse. N'incluez pas le groupe de contrôle pour la modélisation. Excluez mais ne masquez pas la ligne avec le contrôle. De cette façon, vous verrez toujours où le contrôle apparaît mais cela ne provoquera pas de singularité dans l'estimation.
Un de mes collègues vous a suggéré de tester avec une ANOVA unidirectionnelle en concaténant les niveaux des trois facteurs. Ce processus produira un facteur à 9 niveaux, huit traitements plus le contrôle. Vous pouvez désormais tester les différences avec Oneway ou Fit Least Squares.
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesRe-bonjour
Désolé de continuer ce fil de discussion, mais je n'ai toujours pas trouvé le moyen de l'exécuter sans erreur.
Concernant l'ordre des valeurs : c'est juste une question de représentation visuelle dans les rapports de sortie, n'est-ce pas ? J'ai modifié l'ordre pour que le contrôle (0) soit maintenant en bas.Cela ne semble pas faire de différence sur les résultats.
Concernant votre autre commentaire : Oui, je dirais que les facteurs sont tous catégoriels. Par souci de simplicité, je les ai simplement étiquetés « Élevé » et « Faible » dans cet article. Mais permettez-moi de vous donner quelques détails supplémentaires sur l'expérience et les traitements réels.
Je voulais tester l'impact de différentes manières de présenter une information dans un site Internet.
Les informations peuvent être présentées :
1) d’une manière basée sur l’opinion ou sur le comportement.
2) comme provenant soit d'un ensemble d'amis aléatoires, soit d'un ensemble d'amis que le participant a présélectionné (plus tôt dans l'expérience)
3) comme provenant soit d'un nombre élevé d'amis (8 indiqués) soit d'un faible nombre d'amis (2 indiqués).Aucune autre valeur affichée, seulement 2 ou 8 – c'est pourquoi je les ai étiquetés « élevé » et « faible ».
Ainsi, par exemple, un participant pourrait bénéficier du traitement suivant : Il est exposé à informations basées sur le comportement venant d'un aléatoire ensemble de 8 (n° élevé) de ses amis.
Le groupe témoin a consulté le site Web sans cette information particulière. Pour chaque ligne de participants du groupe témoin dans mon ensemble de données, j'ai donc codé le traitement dans les trois « colonnes de facteurs » comme 0.
Ces détails vous rapprochent-ils d’une solution sur la manière dont je devrais inclure le groupe témoin ?
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesVous confondez estimation et test. Les détails de singularité indiquent que le modèle tel que spécifié ne peut pas être estimé. Le niveau de contrôle doit varier indépendamment mais vous ne disposez que d'une seule combinaison avec tous les facteurs définis à ce niveau.
Vos facteurs sont-ils vraiment catégoriques (par exemple, « faible » et « élevé ») ou sont-ils réellement continus (par exemple 50 et 100) ? Le "contrôle" est à 0 ?
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesVous pouvez saisir « contrôle » comme niveau pour chaque facteur. Je vous recommande ensuite d'en faire la dernière valeur avec la propriété de colonne Ordre des valeurs. De cette façon, les estimations des paramètres seront relatives à la valeur de contrôle.
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesSalut Mark
Merci pour la réponse rapide! C'est bon à savoir. Avez-vous également une réponse à ma deuxième question ? C'est-à-dire comment inclure le groupe témoin dans l'ANOVA.Actuellement, les groupes de contrôle sont inclus de la manière suivante : j'ai trois colonnes, une pour chaque facteur. Pour chaque colonne, les participants sont codés soit 1 (pour « faible »), soit 2 (pour « élevé ») ou simplement 0 pour contrôle. Cependant, lorsque j'exécute l'ANOVA (Ajuster le modèle -> choisissez mes trois facteurs et choisissez "Factorial complet" -> choisissez DV -> appuyez sur "exécuter"), JMP renvoie BEAUCOUP de texte lié aux facteurs sous l'en-tête "Détails de singularité". Et le reste des résultats semble également bizarre (par exemple le texte "LostDFs", pas de ratios F, etc. dans la sortie "Effects Tests".Ce problème ne se produit pas lorsque j'exclus le groupe témoin de l'analyse. Pouvez-vous alors nous expliquer comment je devrais inclure le groupe témoin ? Ou devrais-je simplement faire un test t séparé pour tester ma première hypothèse (le traitement est meilleur que le contrôle), puis exécuter l'ANOVA sur les groupes de traitement uniquement pour tester les hypothèses restantes (qui ne se rapportent pas au groupe témoin) ?
Re: ANOVA - codage et structuration des donnéesLe codage est effectué en interne par JMP pour vous. Entrez simplement les niveaux (par exemple, bas et haut) dans les colonnes de données comme vous le souhaitez.
