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Aiuta a raggruppare le lunghezze dei trascritti con intervalli specifici in JMP

Ho circa 60.000 lunghezze di trascrizione di lunghezza variabile da 200 a 10.000 che voglio rappresentare graficamente le loro distribuzioni di lunghezza usando binning (<250, 250 - 500, 500 - 1000, 1000 - 1500, 1500 - 2000, 2000 - 2500, 2500 - 3000,> 3000) con l'ultimo cestino contenente tutte le lunghezze> 3000. Finora non sono stato in grado di capirlo (nuovo per JMP). Ho tutte le trascrizioni in una colonna, un valore per riga.

 

Grazie,

 

Johnny

Ri: Aiuto con binning lunghezze di trascrizione con intervalli specifici in JMP

Grazie per questa sceneggiatura, aiuta molto. Non avevo idea che potessi scrivere in JMP.

 

Johnny

Ri: Aiuto con binning lunghezze di trascrizione con intervalli specifici in JMP

Il modo per farlo è semplicemente creare una nuova colonna e utilizzare una formula abbastanza semplice per creare i bin.  Ecco uno script che fa ciò che vuoi, ma potresti facilmente creare questo in modo interattivo creando la nuova colonna e poi usando l'editor di formule per creare il codice per la formula

Names Default To Here( 1 );
// Create an example data table
dt = New Table( "Bin",
 add rows( 60000 ),
 New Column( "value", numeric, formula( Random Normal( 1500, 600 ) ) )
);
// Make sure all 60,000 get processed before proceeding
wait(2);
// Remove the formula to make the values "real" not virtual values
dt:value << delete property( "formula" );

// Create a new column with a binning formula you want
dt << New Column( "Bin",
 character,
 formula(
  If(
   :value < 250, "<250",
   :value < 500, "250-499",
   :value > 3000, ">3000",
   Char( 500 * Floor( :value / 500 ) ) || "-" || Char(
    500 * Ceiling( :value / 500 ) - 1
   )
  )
 )
);

// Since the bin values will not display alphabetically, set the Value Ordering
// column property to make sure the ordering will display properly
dt:bin << set property(
 "value ordering",
 {"<250", "250-499", "500-999", "1000-1499", "1500-1999", "2000-2499", "2500-2999", ">3000"}
);

PS

Credo che troverai il tuo commento " Qualche idea su come farlo se è possibile? "Diventerà una non domanda, o almeno verrà modificata solo nella prima parte della domanda," Qualche idea su come fare? ".  Usando JMP e JSL puoi trovare o creare tutto ciò di cui hai bisogno.