JMP Genomics para análisis y predicción de fitomejoramiento.<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Hola,
He estado viendo la presentación de Russ Wolfinger sobre análisis y predicción de reproducción. Por desgracia, no puedo copiarlo en mi propia computadora. Sospecho que echo de menos algunas cosas importantes. Por ejemplo, no puedo copiar cómo configura los análisis de regresión de cresta 4-5.
¿Hay tutoriales escritos para la crianza? Estaría feliz de ver eso.
Gracias.
Jahn
Re: JMP Genomics para análisis y predicción de fitomejoramiento.Hola jahn
Primero, busque el proceso de "Validación cruzada y comparación de modelos" en el menú JMP Genomics. La ruta del menú para este proceso es: "Modelo predictivo >> Comparaciones de modelos >> Validación cruzada y comparación de modelos ". Una vez que llegue a este proceso, haga clic en él para abrir la ventana de proceso. En la nueva ventana, vaya a la pestaña "General", donde seleccionará la carpeta que contiene los archivos de configuración para los modelos que desea comparar haciendo clic en el botón "Elegir" para el campo "Carpeta de archivos de configuración". Elija la ruta de la carpeta donde se encuentran los archivos de configuración. Si usó el proceso de "Revisión del modelo predictivo" para crear los archivos de configuración, elija la carpeta de salida para la "Revisión del modelo predictivo" como la "Carpeta de archivos de configuración". En este punto, verá en el panel izquierdo todos los archivos de configuración disponibles. Haga clic y resalte todas las configuraciones en las que desea ejecutar la validación cruzada y la comparación de modelos y haga clic en el signo de flecha "->" para enviarlos al panel derecho. También puede configurar la carpeta de salida en la pestaña General. Ahora, vaya a la pestaña "Análisis" y elija el "Método de retención" (una buena es la Partición aleatoria), también elija el "Tamaño de retención, especificar como:" ("K para K-Fold o 1 / K Hold-Out "es bastante estándar, así que puedes usarlo. A continuación, configure un número para "K para K-Fold o 1 / K Hold-Out" (si tiene un tamaño de muestra de 100 y elige K = 4, entonces el conjunto de datos se dividirá en cuatro partes, a su vez cada una de se utilizarán como conjunto de datos de entrenamiento, y el resto como conjunto de prueba). Finalmente, establezca un número para "Número de iteraciones de retención aleatorias" (este es el número de veces que se procesará la validación cruzada; cuanto mayor, mejor, sin embargo, puede llevar mucho tiempo, por lo que sugeriría probar 5). Puede dejar todas las demás opciones por defecto.
¡Buena suerte con tus análisis!
Re: JMP Genomics para análisis y predicción de fitomejoramiento.Hola de nuevo,
Me di cuenta de que uno mismo 
Hasta donde puedo entender, cuando configuro varios modelos como Russ Wolfinger en su tutorial, debe presionar el botón "Actualizar revisión" para cada modelo.
Todavía no he descubierto cómo hace las comparaciones de modelos basadas en BLUP. ¿Puede alguien ayudarme aquí?
Gracias
Jahn
