植物育種分析と予測のためのJMPゲノム<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />こんにちは、
私は育種分析と予測に関するラス・ヴォルフインガーの発表を見てきました。ああ、私は自分のコンピューターに彼をコピーすることはできません。私はいくつかの重要なものを逃したのではないかと思います。例えば、私は彼が4-5尾根回帰分析をどのように設定したかをコピーすることはできません。
繁殖用のチュートリアルはありますか。私はそれを見てうれしいです。
ありがとうございました。
ヤーン
植物育種分析と予測のためのJMPゲノムこんにちはJahn、
まず、JMP Genomicsメニューで "Cross Validation and Model Comparison"プロセスを見つけます。このプロセスへのメニューパスは次のとおりです。"予測モデリング>>モデル比較>> 相互検証とモデル比較 "＃：。このプロセスに到達したら、それをクリックしてプロセスウィンドウを開きます。新しいウィンドウで、[全般]タブに移動し、[設定ファイルのフォルダ]フィールドの[選択]ボタンをクリックして、比較するモデルの設定ファイルを保存するフォルダを選択します。設定ファイルが保存されているフォルダのパスを選択します。「Predictive Model Review」プロセスを使用して設定ファイルを作成した場合は、「Predictive Model Review」の出力フォルダーを「設定ファイルのフォルダー」として選択します。この時点で、左側のパネルに利用可能なすべての設定ファイルが表示されます。交差検定およびモデル比較を実行したいすべての設定をクリックして強調表示し、矢印「 - >」記号をクリックしてそれらを右側のパネルに送信します。出力フォルダも[全般]タブで設定できます。さて、"解析"タブに移動し、"ホールドアウト方法"（良いのはランダムパーティションです）を選択し、また "ホールドアウトサイズ、次のように指定してください。"（ "Kフォールドの場合はKまたは1 / 「K Hold-Out」はかなり標準的なので、使用できます。次に、「K倍または1 / KホールドアウトのK」に数値を設定します（サンプルサイズが100で、K = 4を選択した場合、データセットは4つの部分に分割されます。それらはトレーニングデータセットとして使用され、残りはテストセットとして使用されます）。最後に、"Number of random hold-out iterations"の値を設定します（これは交差検証が処理される回数です。しかし、より良いほど、時間がかかる可能性があるので、5を試してみることをお勧めします）。他のすべてのオプションはデフォルトのままにしておくことができます。
あなたの分析に頑張ってください！
植物育種分析と予測のためのJMPゲノムまた会ったね、
私が理解できる限り、彼のチュートリアルでRuss Wolfingerのようにいくつかのモデルを設定するときは、各モデルに対して[Update Review]ボタンを押す必要があります。
それでも私は、彼がBLUPに基づいてモデルを比較する方法を考え出していません。誰かが私をここで手伝ってくれる？
ありがとうございました
ヤーン
