¿Alguien sabe cómo hacer un gráfico de circos para el análisis de la sintenidad utilizando JMP Genomics?
Hola,
Es posible. Para hacer uno, usa el navegador Genoma en Vistas del Genoma. Aquí hay un enlace a la documentación:
https://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=ST_G_GV_0001.html
La clave será utilizar la pestaña Enlace en el cuadro de diálogo para este proceso. Aquí hay un enlace con un par de detalles más:
http://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=PA_G_GV_0094.html
Se muestra un buen ejemplo de lo que necesitará haciendo clic en el botón "Cargar" en la parte inferior del cuadro de diálogo y seleccionando la configuración de ejemplo de AffyHuEx1Circular. Esto mostrará algunos ajustes de ejemplo y un ejemplo de Conjunto de datos de entrada de SAS de enlaces que puede abrir para ver qué necesitará para establecer los enlaces entre los cromosomas.
Si necesita más, puede ponerse en contacto con support@jmp.com.
Gracias,
Chris Kirchberg
