Weiß jemand, wie man mit JMP Genomics einen Circos-Plot für die Synteny-Analyse erstellt?
Hallo,
Es ist möglich. Verwenden Sie dazu den Genome-Browser unter Genome-Ansichten. Hier ist ein Link zur Dokumentation:
https://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=ST_G_GV_0001.html
Der Schlüssel ist die Verwendung der Link-Registerkarte im Dialogfeld für diesen Prozess. Hier ist ein Link mit ein paar weiteren Details:
http://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=PA_G_GV_0094.html
Ein gutes Beispiel für das, was Sie benötigen, können Sie anzeigen, indem Sie auf die Schaltfläche "Laden" unten im Dialogfeld klicken und die Beispieleinstellungen für AffyHuEx1Circular auswählen. Hier werden einige Beispieleinstellungen und ein Beispiel für Links SAS Input Data Set angezeigt, das Sie öffnen können, um zu sehen, was Sie zum Herstellen der Verbindungen zwischen den Chromosomen benötigen.
Wenn Sie mehr benötigen, wenden Sie sich bitte an support@jmp.com.
Vielen Dank,
Chris Kirchberg
