再:アドインのクロスマッピングあるいは、アーカイブからOneMapバージョン2.0.4以前をインストールすることもできます。 https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/onemap/ 。このバージョンは、JMP Genomics 9.0以前のOutcrossアドインと互換性があります。ご参考までに、Windowsシステム用のOneMap_2.0.4.zipを添付します。
再:アドインのクロスマッピングエラー:R:rf.2ptsのエラー(outcross.obj、LOD = NULL、max.rf = NULL、詳細= FALSE)
エラー:R:関数 "rf.2pts"が見つかりませんでした
上記のエラーメッセージは、OneMapパッケージ(バージョン2.1.0以降)のアップデートによるものです。これらの更新はいくつかのR関数(関数名、そしていくつかの内部ルーチン)に影響を及ぼし、それらはバージョン9.0までのJMP GenomicsのOutcrossアドインでエラーを引き起こすでしょう。OutcrossアドインをバージョンOneMap 2.1.0および2.1.1(4月9日にCRANで入手可能な最新のOneMapバージョン)と互換性があるようにするために、JMP Genomicsで必要な修正がすでに行われています。番目 、2018)。これらの修正は、JMP Genomicsの次のリリースで利用可能になる予定です。その間、テクニカルサポートチームに連絡して、この問題に関するサポートを依頼してください。
再:アドインのクロスマッピングこんにちはSalih、
JMP Genomicsの開発者の1人があなたに直接電子メールを送ってあなたの質問に答えたのかもしれないと思います。ここにコメントがあるので、同じ状況に自分自身を見つけるかもしれない他の人も答えを持つことができます。
PlesaeはOneMap Rパッケージがインストールされていることを確認してJMP Genomicsを再起動します。
それでもエラーメッセージが表示される場合は、お知らせください。
クリス
再:アドインのクロスマッピングChris様、
ありがとうございます。
それはうまくいったし、私はRLANGエラーメッセージを受け取らなかった。
しかし、再結合を実行しようとしたときにエラーメッセージが表示されました。
およびアドインのもとでの連鎖グループ分析:交差連鎖マップ分析。私
デフォルトのサンプルファイル(simuf1)を使って再結合と連鎖グループを実行する
分析。
LinkageGroupOutcrossプロセスで以下のエラーが発生しました
エラー:R:rf.2ptsのエラー(outcross.obj、LOD = NULL、max.rf = NULL、詳細)
= FALSE):
エラー:R:関数 "rf.2pts"が見つかりませんでした
エラー:R:get.2pts.analysis(twopts.obj)のエラー:オブジェクト 'twopts.obj'が違います
見つかった
エラー:R:eval(expr、p)のエラー:オブジェクト 'rfmat.obj'が見つかりません
エラー:R:呼び出し:.SASExportDataExchangeFile - > eval.parent - > eval - > eval
エラーメッセージが表示される理由を教えてください。
デフォルトファイルを使用してリンケージマップオーダーも実行します
LinkageMapOrderOutcrossプロセスで以下のエラーが発生しました
エラー:R:make.seq(twopts.obj、"all")のエラー:関数が見つかりませんでした
"make.seq"
エラー:R:eval(expr、p)のエラー:オブジェクト 'mappedm.final'が見つかりません
エラー:R:呼び出し:.SASExportDataExchangeFile - > eval.parent - > eval - > eval
エラーメッセージが表示される理由を教えてください。
* QTL解析も実行しましたが、エラーメッセージが表示されませんでした。*
再:アドインのクロスマッピングこんにちはSalih、
私は開発からいくつかのコメントを受けました。これを試して:
- JMP Genomicsを完全にシャットダウンし、JMPとSASがバックグラウンドで実行されていないことを確認してください(調べるためにタスクマネージャを使用してください)
- コンピュータを再起動して、Rのインストールによって追加された可能性のあるレジストリまたはシステム変数が認識されていることを確認します。
- SASセッションを開き([スタート] - [SAS] - [SAS 9.4])、エディタウィンドウに次のように入力します。
- proc options option = RLANG;
走る。
- ツールバーの一番上にある走っている人のように見えるボタンをクリックしてください
- ログをチェックインすると、ログウィンドウにメッセージが表示されます。
- それが戻った場合:
- 「ノルラン R言語インタフェースへのアクセスをサポートしないでください。"SASシステムからRを呼び出す権限がありません。
- "RLANG R言語インタフェースへのアクセスをサポート "、SASシステムからRを呼び出すことができます。あなたのR_Home環境を確認してください。このリンクを見なさい:
https://stackoverflow.com/questions/19525903/editing-sas-config-files-to-execute-r-making-sas-play-well-with-others
あなたがまだ問題を抱えているかどうか私に知らせてください。
クリス
Re:アドインのアウトクロスマッピングこんにちはサリー、
編集後にJMPゲノミクスを再起動しましたかsasv9.cfgファイル? 編集を有効にするには、JMPGenomicsを閉じてから再度開く必要があります。
解決策を見つけられるように、私に連絡してください。
ありがとう、
ルチアーノ
アドインアウトクロスマッピングJMPGenomicsソフトウェアのアドインにアウトクロスリンケージマップ分析をインストールしました。 また、C:\ Program Files \ SASHome \ SASFoundation \ 9.4 \ nls \ en \ sasv9.cfgの下のsasv9.cfgファイルの最初のレーンに-RLANGを記述しました。 ただし、リンケージ分析を実行すると、以下のエラーメッセージが表示されます。
経験が必要です。
ご多幸を祈る
サリー
エラー:RLANGシステムオプションをSAS構成ファイルまたはSAS呼び出しコマンドラインで指定して、
R言語ステートメントの提出。
16632 ^ isOKの場合、実行します。
その他