Ri: mappatura di outcross dei componenti aggiuntivi In alternativa, è possibile installare OneMap versione 2.0.4 o precedente dall'archivio https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/onemap/ . Questa versione è compatibile con il componente aggiuntivo Outcross in JMP Genomics 9.0 e versioni precedenti. Per tua comodità, sto collegando OneMap_2.0.4.zip per il sistema Windows.
Ri: mappatura di outcross dei componenti aggiuntiviERRORE: R: Errore in rf.2pts (outcross.obj, LOD = NULL, max.rf = NULL, verbose = FALSE)
ERRORE: R: impossibile trovare la funzione "rf.2pts"
I messaggi di errore visualizzati sopra sono dovuti agli aggiornamenti nel pacchetto OneMap (a partire dalla versione 2.1.0). Questi aggiornamenti hanno effetti in alcune funzioni R (nomi di funzioni e alcune routine interne) e causeranno errori nel componente aggiuntivo Outcross di JMP Genomics fino alla versione 9.0. Le correzioni necessarie in JMP Genomics hanno già avuto luogo per rendere il componente aggiuntivo Outcross compatibile con le versioni OneMap 2.1.0 e 2.1.1 (l'ultima versione OneMap disponibile in CRAN il 9 aprile esimo , 2018). Queste correzioni saranno disponibili nella prossima versione di JMP Genomics. Nel frattempo, contattare il team di supporto tecnico per chiedere assistenza in merito a questo problema.
Ri: mappatura di outcross dei componenti aggiuntiviCiao Salih,
Credo che uno degli sviluppatori di JMP Genomics potrebbe aver risposto alla tua domanda inviandoti direttamente un'email. Ecco il commento in modo che anche altri che potrebbero trovarsi nella stessa situazione possano avere la risposta.
Plesae assicurarsi che il pacchetto OneMap R sia installato e riavviare JMP Genomics.
Se ricevi ancora un messaggio di errore, faccelo sapere.
Chris
Ri: mappatura di outcross dei componenti aggiuntiviCaro Chris,
GRAZIE.
Ha funzionato e non ho ricevuto il messaggio di errore RLANG.
Tuttavia, ho ottenuto sotto il messaggio di errore quando ho tentato di eseguire la ricombinazione
e analisi del gruppo di collegamento sotto componenti aggiuntivi: analisi della mappa di collegamento outcross. io
utilizzato il file di esempio predefinito (simuf1) per eseguire il gruppo di ricombinazione e collegamento
analisi.
Il seguente errore si è verificato nel processo LinkageGroupOutcross
ERRORE: R: Errore in rf.2pts (outcross.obj, LOD = NULL, max.rf = NULL, verbose
= FALSE):
ERRORE: R: impossibile trovare la funzione "rf.2pts"
ERRORE: R: Errore in get.2pts.analysis (twopts.obj): oggetto 'twopts.obj' non
trovato
ERRORE: R: Errore in eval (expr, p): oggetto 'rfmat.obj' non trovato
ERRORE: R: Chiama: .SASExportDataExchangeFile -> eval.parent -> eval -> eval
Per favore, puoi scrivere qual è la ragione per ottenere un messaggio di errore.
Eseguo anche l'ordine della mappa di collegamento utilizzando i file predefiniti
Il seguente errore si è verificato nel processo LinkageMapOrderOutcross
ERRORE: R: Errore in make.seq (twopts.obj, "all"): impossibile trovare la funzione
"Make.seq"
ERRORE: R: Errore in eval (expr, p): oggetto 'mappedm.final' non trovato
ERRORE: R: Chiama: .SASExportDataExchangeFile -> eval.parent -> eval -> eval
Per favore, puoi scrivere qual è la ragione per ottenere un messaggio di errore.
* Eseguo anche l'analisi QTL e non ho ricevuto alcun messaggio di errore. *
Ri: mappatura di outcross dei componenti aggiuntiviCiao Salih,
Ho ricevuto alcuni commenti dallo sviluppo. Prova questo:
- Chiudi completamente JMP Genomics e assicurati che JMP e SAS non funzionino in background (usa Task Manager per scoprirlo)
- Riavvia il computer per assicurarti che eventuali variabili del registro o del sistema vengano ora riconosciute che potrebbero essere state aggiunte dall'installazione R
- Aprire una sessione SAS (Start> SAS> SAS 9.4) e digitare quanto segue nella finestra dell'Editor:
- opzione opzioni proc = RLANG;
correre;
- Fai clic sul pulsante che sembra un uomo che corre in alto nella barra degli strumenti
- Controlla nel registro e dovrebbe restituire un messaggio nella finestra del registro
- Se restituisce:
- "NORLANG Non supportano l'accesso alle interfacce del linguaggio R ", non si dispone dell'autorizzazione per chiamare R dal sistema SAS.
- "RLANG Supporta l'accesso alle interfacce del linguaggio R ", è possibile chiamare R dal sistema SAS. Controlla il tuo R_Home Environtment. Vedi questo link:
https://stackoverflow.com/questions/19525903/editing-sas-config-files-to-execute-r-making-sas-play-well-with-others
Fammi sapere se hai ancora problemi.
Chris
Ri: Mappatura outcross dei componenti aggiuntiviCiao Salih,
Hai riavviato JMP Genomics dopo aver modificato il file sasv9.cfg? È necessario chiudere JMP Genomics e riaprirlo affinché la modifica abbia effetto.
Per favore, torna da me così possiamo trovare una soluzione.
Grazie,
Luciano
Mappatura outcross dei componenti aggiuntiviHo installato l'analisi della mappa di collegamento outcross nei componenti aggiuntivi del software JMP Genomics. Ho scritto anche -RLANG nella prima corsia del file sasv9.cfg in C: \ Program Files \ SASHome \ SASFoundation \ 9.4 \ nls \ en \ sasv9.cfg. Tuttavia, ricevo ancora il messaggio di errore sotto quando eseguo l'analisi del collegamento.
Ho bisogno della tua esperienza al riguardo.
Auguri
Salih
ERRORE: l'opzione di sistema RLANG deve essere specificata nel file di configurazione SAS o sulla riga di comando di chiamata SAS per abilitare
presentazione di dichiarazioni in linguaggio R.
16632 se ^ isOK allora fallo;
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