Re:Add-Ins outcross mapping或者,您可以從存檔中安裝OneMap 2.0.4或更早版本 https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/onemap/ 。此版本與JMP Genomics 9.0及更早版本中的Outcross Add-In兼容。為方便起見,我正在為Windows系統附加OneMap_2.0.4.zip。
Re:Add-Ins outcross mapping錯誤:R:rf.2pts出錯(outcross.obj,LOD = NULL,max.rf = NULL,詳細= FALSE)
錯誤:R:找不到功能“rf.2pts”
上面顯示的錯誤消息是由於OneMap軟件包中的更新(從版本2.1.0開始)。這些更新在某些R函數(函數名稱和一些內部例程)中有效,並且它們將導致JMP基因組學的Outcross加載項中的錯誤,最高版本為9.0。JMP Genomics中已經進行了必要的修復,使Outcross Add-In與OneMap 2.1.0和2.1.1版本兼容(4月9日CRAN中提供的最新OneMap版本) 日 ,2018年)。這些修復程序將在JMP Genomics的下一版本中提供。同時,請聯繫技術支持團隊以諮詢有關此問題的幫助。
Re:Add-Ins outcross mapping嗨薩利赫,
我相信JMP Genomics的開發人員之一可能通過直接向您發送電子郵件來回答您的問題。這是評論,所以其他可能發現自己具有相同情況的人也可以得到答案。
Plesae確保安裝了OneMap R軟件包並重新啟動JMP Genomics。
如果您仍然收到錯誤消息,請告訴我們。
克里斯
Re:Add-Ins outcross mapping親愛的克里斯,
謝謝。
它工作,我沒有得到RLANG錯誤消息。
但是,當我嘗試運行重組時,我收到以下錯誤消息
和加載項下的連鎖群分析:異交連鎖圖分析。一世
使用默認樣本文件(simuf1)來運行重組和鏈接組
分析。
在進程LinkageGroupOutcross中發生以下錯誤
錯誤:R:rf.2pts出錯(outcross.obj,LOD = NULL,max.rf = NULL,詳細
= FALSE):
錯誤:R:找不到功能“rf.2pts”
錯誤:R:get.2pts.analysis(twopts.obj)中的錯誤:對象'twopts.obj'沒有
發現
錯誤:R:eval中的錯誤(expr,p):找不到對象'rfmat.obj'
錯誤:R:調用:.SASExportDataExchangeFile - > eval.parent - > eval - > eval
請你寫一下收到錯誤信息的原因。
我還使用默認文件運行鏈接映射順序
在進程LinkageMapOrderOutcross中發生以下錯誤
錯誤:R:make.seq中出錯(twopts.obj,“all”):找不到函數
“make.seq”
錯誤:R:eval中的錯誤(expr,p):找不到對象'mappedm.final'
錯誤:R:調用:.SASExportDataExchangeFile - > eval.parent - > eval - > eval
請你寫一下收到錯誤信息的原因。
*我也運行QTL分析,沒有收到任何錯誤信息。*
Re:Add-Ins outcross mapping嗨薩利赫,
我收到了一些發展評論。試試這個:
- 完全關閉JMP Genomics並確保JMP和SAS未在後台運行(使用任務管理器查找)
- 重新啟動計算機以確保現在可以識別可能已由R安裝添加的任何註冊表或系統變量
- 打開SAS會話(“開始”>“SAS”>“SAS 9.4”),然後在“編輯器”窗口中鍵入以下內容:
- proc options option = RLANG;
跑;
- 單擊工具欄頂部看起來像跑步者的按鈕
- 簽入日誌,它應該在日誌窗口中返回一條消息
- 如果它返回:
- “NORLANG 不支持訪問R語言接口“,您無權從SAS系統調用R。
- “RLANG 支持訪問R語言接口“,您可以從SAS系統調用R. 檢查你的R_Home Environtment。看到這個鏈接:
https://stackoverflow.com/questions/19525903/editing-sas-config-files-to-execute-r-making-sas-play-well-with-others
如果您還有問題,請告訴我。
克里斯
回复:外接程序跨站映射薩利赫,你好
您在編輯完JMP Genomics之後是否重新啟動了sasv9.cfg文件? 您必須關閉JMP Genomics並將其重新打開才能使編輯生效。
請回到我身邊,以便我們制定解決方案。
謝謝,
盧西亞諾
外接程序外接映射我在JMP Genomics軟件的加載項中安裝了交叉鏈接圖分析。 我還在C:\ Program Files \ SASHome \ SASFoundation \ 9.4 \ nls \ en \ sasv9.cfg下的sasv9.cfg文件的第一行中也寫了-RLANG。 但是,當我運行鏈接分析時,仍然出現以下錯誤消息。
我需要你的經驗。
最好的祝愿
薩利赫
錯誤:必須在SAS配置文件或SAS調用命令行中指定RLANG系統選項,才能啟用
提交R語言聲明。
16632如果^ isOK然後執行;
其他