JMPGで遺伝子型を再コーディングすると、出力データセットが不完全になるこんにちは、
遺伝子型データセット（〜40 k SNP）を二倍体フォーマット（A / G、G / Cなど）から数値フォーマット（0、ホモ、1、ヘテロ、2、ホモ）に書き換えようとしています。再コーディングは良さそうに見えます、問題は私のデータ出力が不完全であるということです（それは〜29 kのSNPしか含んでいません）。他のマーカーで何が起こったのかを示すエラーやメッセージが表示されることはありません。
この問題を解決するための手がかりをください。
JMP Genomics 8.2を使用しています
ありがとう
JMPGで遺伝子型を再コーディングすると不完全な出力データセットが生成されるこんにちは @lfsamayo_ncsu_e 、
それは華麗です。295988 SNPをAA、AB、およびBBから0、1、および2に変更しました。 すべてのSNPがあります。JMP Genomics 9.0を使用しています。
サポートに電話をかけるか、support @ jmp.comに電子メールで連絡し、問題がある可能性があるかどうかを尋ねてください。
ベスト、
クリス
