JMPG에서 유전자형을 재 코딩하면 불완전한 출력 데이터 세트가 생성됩니다.여보세요,
저는 이원 체형 (예 : A / G, G / C 등)에서 숫자 형식 (0, 호모 1, 헤테 2, 호모)으로 유전자형 데이터 세트 (~ 40 k SNPs)를 다시 코딩하려고합니다. 다시 코딩하는 것이 좋지만 문제는 데이터 출력이 불완전하다는 것입니다 (~ 29 k SNP 만 포함). 나머지 마커에서 발생한 일을 나타내는 오류나 마사지를받지 않습니다.
이 문제를 해결할 수있는 단서를주세요.
JMP Genomics 8.2를 사용하고 있습니다.
감사
재 : JMPG에서 유전자형 재 코딩은 불완전한 출력 데이터 세트를 산출한다.안녕하세요 @lfsamayo_ncsu_e ,
그것은 우스꽝 스럽다. 방금 AA, AB 및 BB의 295988 SNP를 0,1 및 2로 기록했습니다. 모든 SNP가 있습니다. JMP Genomics 9.0을 사용하고 있습니다.
지원 전화를하거나 support@jmp.com으로 이메일을 보내 문제가 무엇인지 물어보십시오.
베스트,
크리스
