使用管家基因進行批量效應調整您好，從帶有計數數據的txt文件開始，我正在分析來自三個不同獨立實驗的RNAseq數據，這些實驗應合併為單個分析。樣本特徵（例如疾病狀況）在批次內完全混淆。管家基因的使用，例如Eisenberg等人提出的那些基因。（ http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2013.05.010 ），可能是解決批量效應的一種方法。JMP Genomics中是否有一種方法可以指定可用於調整批次的基因組？
非常感謝您的參與。
Re：使用管家基因調整批次效果嗨，
在JMP Genomics中，您可以在Expression> Normalization中使用Loess Normalization來指定用於標準化的控制集或管家基因集。 請參閱此處的文檔
http://www.jmp.com/support/downloads/JMPG90_documentation/wwhelp/wwhimpl/js/html/wwhelp.htm#href=PA_G_EX_0342.html
希望這可以幫助，
克里斯
