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Selezione genica per riduzione dell'insieme di espressione genica

Cara comunità JMP,

Sto usando JMP 13.1 e mi sono chiesto se c'è una soluzione per il mio problema: sto attualmente lavorando sul cancro della vescica uroteliale espressione genica e ho trovato un interessante cluster di espressione genica di circa 100 geni. Ora voglio ridurre questo cluster al minor numero di geni, ma non so come potrei farlo con JMP. Esiste qualche possibilità statistica in JMP di studiare un numero ridotto di geni con un adattamento ottimale verso il cluster genico più grande?

Cordiali saluti,

Markus

Re: selezione genica per riduzione dell'insieme di espressione genica

HI Markus,

In JMP 13 c'è qualcosa chiamato Cluster Variables. Questo potrebbe aiutare con i 100 o più geni che hai. Oppure puoi usare il set più grande e allo stesso tempo segnare la lista dei 100 geni con un pennarello o un colore in modo da sapere dove si trovano all'interno della piattaforma Cluster Variables. Controlla l'aiuto su questo:

http://www.jmp.com/support/help/13-1/Cluster_Variables.shtml#

Spero che sia d'aiuto,

Chris Kirchberg

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