42071_de-DE

liliconcom

Genselektion zur Reduktion des Genexpressionssatzes

Liebe JMP-Community,

 

Ich verwende JMP 13.1 und fragte mich, ob es eine Lösung für mein Problem gibt: Ich arbeite derzeit an der Genexpression von urothelialem Blasenkrebs und fand einen interessanten Genexpressionscluster mit etwa 100 Genen. Jetzt möchte ich diesen Cluster auf eine geringere Anzahl von Genen reduzieren, aber ich weiß nicht, wie ich dies mit JMP durchführen könnte. Gibt es eine statistische Möglichkeit in JMP, eine reduzierte Anzahl von Genen mit optimaler Anpassung an den größeren Gencluster zu untersuchen?

 

Mit freundlichen Grüßen,

 

Markus

Re: Genselektion für die Reduktion des GenexpressionssatzesHI Markus,

In JMP 13 gibt es so genannte Clustervariablen. Das könnte bei den etwa 100 Genen helfen, die Sie haben. Oder Sie können den größeren Satz verwenden und gleichzeitig die 100-Gen-Liste mit einem Marker oder einer Farbe markieren, so dass Sie wissen, wo sie unter die Cluster-Variablen-Plattform fallen. Schauen Sie sich die Hilfe dazu an:

http://www.jmp.com/support/help/13-1/Cluster_Variables.shtml#

Hoffentlich hilft das,

Chris Kirchberg