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Sélection de gènes pour la réduction des ensembles d'expression génique

Chère communauté JMP,

 

J'utilise JMP 13.1 et je me suis demandé s'il existe une solution à mon problème: je travaille actuellement sur l'expression génique du cancer de la vessie urothéliale et j'ai trouvé un groupe intéressant d'expression génique d'environ 100 gènes. Maintenant, je veux réduire ce groupe à un plus petit nombre de gènes, mais je ne sais pas comment je pourrais le faire avec JMP. Y at-il une possibilité statistique dans JMP d’étudier un nombre réduit de gènes parfaitement adaptés au groupe de gènes plus important?

 

Sincères amitiés,

 

Markus

Re: Sélection de gènes pour la réduction des ensembles d'expression géniqueHI Markus,

Dans JMP 13, il existe quelque chose appelé Variables de cluster. Cela pourrait aider avec la centaine de gènes que vous avez. Ou vous pouvez utiliser sur le plus grand ensemble tout en marquant simultanément la liste des 100 gènes avec un marqueur ou une couleur afin de savoir où ils se situent dans la plate-forme Variables de cluster. Découvrez l'aide sur ceci:

http://www.jmp.com/support/help/13-1/Cluster_Variables.shtml#

J'espère que cela pourra aider,

Chris Kirchberg