DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoHola comunidad,
Estoy intentando diseñar un experimento de superficie de respuesta pero no estoy seguro de cómo puedo incluir variables que cambien de nivel durante el experimento. ¿Cómo puedo trazar variables con niveles cambiantes en el editor DoE personalizado?
Restricciones:
- 24 experimentos en 1 bloque (no estoy seguro si es posible)
- El experimento dura 16 días con puntos de muestreo todos los días (con una curva de respuesta (Y) como resultado)
- Diseño de superficie de respuesta con 4 variables (todas continuas con 3 niveles: -1, 0, 1):
- X1 (-> X1_end el día del cambio)
- X2 (-> X2_end el día del cambio)
- Día del cambio
- Factor de tasa de cambio (F)
- X1 y X2 se 'traducen' a X1_end y X2_end el día Z mediante un factor (F).
He intentado visualizarlo en la imagen adjunta.
¡Muchas gracias!
Diseño de experimentosRe: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentotodas buenas sugerencias. Los revisaré todos y los compararé entre sí una vez que haya obtenido mis datos.
muchas gracias por toda la ayuda
PD: Adjunto hay una visualización del diseño (sin ejes, pero se entiende) 
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoEn Ajustar modelo puede especificar todas las respuestas en el rol Y. En este caso, deberá ajustar el mismo modelo (por ejemplo, el modelo RSM completo) a todas las respuestas. En la parte inferior del informe habrá un generador de perfiles con todas las respuestas juntas.
O puede ajustar diferentes modelos a cada respuesta y luego guardarlos como columnas de Fórmula de predicción en la tabla. Luego puede perfilar todos estos: use Profiler en el menú Graph.
No he probado el perfilador espectral en PLS. Creo que eso podría funcionar. Le echaré un vistazo si tengo tiempo. Si tienes la oportunidad de intentarlo, ¿puedes decirme si funciona?
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoEsto me lleva a otros aspectos prácticos:
¿Existe una manera fácil de concatenar análisis de cada punto de tiempo en una ventana del generador de perfiles? ¿Existe una opción para cargar modelos reducidos de cada punto de tiempo directamente en un perfilador espectral, por ejemplo?
muchas gracias
PD: Estoy tratando de felicitarlos a todos, pero los botones no me funcionan.
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoMi idea original era simplemente tomar cada punto de tiempo y analizar con respecto a mis factores tal como están en el punto de tiempo, y luego concatenar todos los análisis al final. Pero pensé que podría haber una manera más fácil de hacerlo. ¡Pero ya que lo sugieres, creo que lo reconsideraré! Impresionante
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentohola phil,
Cada una de las ejecuciones del experimento es un biorreactor que ejecuta un lote alimentado completo, así que sí, una ejecución completamente nueva cada vez. Todos los biorreactores son programables y los factores de alimentación son la ejecución de una ecuación que da como resultado un volumen absoluto (que puedo analizar como un %).
A tus otras preguntas:
¿Todas las configuraciones posibles tienen sentido? Sí, todos lo hacen y todos son interesantes para mí.
¿Todos los escenarios son factibles? Sí, he seleccionado rangos para acomodar lo que es posible en este sistema en particular (y para futuras ampliaciones).
¿Puede interpretar el efecto de los cambios en los factores de una manera que tenga sentido para el objetivo del experimento? Eso espero, en principio puedo calcular la productividad de cada celda y ver cómo cambia con el tiempo. Así que espero correlacionar eso con la forma en que el feed cambia con el tiempo (por ejemplo).
Recomendaría simular algunos datos de respuesta para verificar esto ( blog sobre simular respuestas ). Lo comprobaré, gracias!
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoSe me ocurre que el aspecto complicado de esto es que todos los factores podrían estar activos para la respuesta en el punto final, pero algunos factores no son relevantes para la respuesta en puntos de tiempo anteriores (antes del cambio en X1 y X2). No creo que esto sea un problema para la forma en que diseñas el experimento. Es algo en lo que tendrá que pensar para el análisis. Antes de analizar la curva completa con PLS, es posible que desee analizar cada punto de tiempo como una respuesta separada para verificar que tenga sentido.
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoHola,
Esto es muy interesante. Gracias por compartir.
No veo ningún problema con el experimento que has propuesto.
Por lo que entiendo, cada una de las ejecuciones del experimento es una ejecución completamente nueva del proceso. Las cosas se complican más cuando ese no es el caso y es necesario considerar factores difíciles de cambiar.
Piensa en cómo se verá el modelo al final. Imagine el generador de perfiles de predicción que obtendrá (por ejemplo, a continuación). ¿Todas las configuraciones posibles tienen sentido? ¿Todos los escenarios son factibles? ¿Puede interpretar el efecto de los cambios en los factores de una manera que tenga sentido para el objetivo del experimento? Recomendaría simular algunos datos de respuesta para verificar esto ( blog sobre simular respuestas ).
Saludos,
phil
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoHola Ian, puedo hacer eso. El experimento es un cultivo celular alimentado por lotes: la respuesta es una curva de concentración de la proteína que producen las células (y el valor final).
El propósito del experimento es optimizar la concentración de proteínas variando dos alimentaciones (X1 y X2). Las concentraciones de alimentación se cambiarán en un 'día de cambio' a X1_end y X2_end (he decidido no incluir el 'factor de cambio (F)' mencionado anteriormente).
Los alimentos se entregan al cultivo celular una vez al día durante el lote de alimentación y contienen varios nutrientes. Cada alimentación se entrega en un % y se puede tratar como una variable continua. El día de cambio también es una variable continua. Todos los factores son fáciles de cambiar. Dado que las células están creciendo y tienen cambios metabólicos durante el lote de alimentación, necesitarán diferentes cantidades de alimentos (complejos) en diferentes momentos durante el cultivo. No sé qué puede o no estar limitando los feeds en este momento, pero sé que los rangos que estoy examinando son relevantes.
Mi pregunta es: ¿es posible incluir 5 factores continuos cuando cada uno de ellos solo está activo durante un cierto período durante el experimento? ¿Cómo debo tratar los factores que cambian de nivel durante el experimento? ¿Existe una regla general?
Si trazo en 5 factores continuos &RS en el editor DoE personalizado, obtengo 28 experimentos recomendados para realizar, lo cual está bien (ver archivo adjunto). También asumo que no todos los factores están activos. El poder no es impresionante en este experimento, pero puedo aumentarlo, si es necesario. Una vez que tengo los datos, puedo hacer el análisis en el punto de tiempo final, pero también quiero la opción de realizar PLS en la curva de concentración frente a mis factores a lo largo del tiempo.
Podría estar muy lejos Y es por eso que estoy aquí.
Espero que esto aclare un poco las cosas
¡Gracias!
Re: DoE personalizado (RSM) con variables que cambian de nivel durante el experimentoSin revelar secretos comerciales, ¿puede decir un poco más sobre cuáles son los factores X1 y X2, por favor? Además, algunos detalles más sobre cuál es la respuesta y lo que espera aprender del experimento sería bueno.
En DoE, manipulas activamente los niveles de los factores elegidos para aprender algo específico. Al usar 'difícil' y 'muy difícil' para cambiar los factores, puede manejar situaciones en las que la configuración experimental dicta que el cambio entre los niveles de los factores tiene algunas restricciones. Tengo la sensación de que esto podría ser lo que está tratando de hacer, pero no estoy seguro de lo que ha escrito.
