DoE personalizzato (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoCiao Comunità,
Sto cercando di progettare un esperimento sulla superficie di risposta, ma non sono sicuro di come includere variabili che cambiano livello durante l'esperimento. Come posso tracciare variabili con livelli variabili nell'editor DoE personalizzato?
Vincoli:
- 24 esperimenti in 1 blocco (non sono sicuro che sia possibile)
- L'esperimento dura 16 giorni con punti di campionamento ogni giorno (con una curva di risposta (Y) come risultato)
- Design della superficie di risposta con 4 variabili (tutte continue con 3 livelli: -1, 0, 1):
- X1 (-> X1_fine il giorno della modifica)
- X2 (-> X2_fine il giorno della modifica)
- Giorno del cambiamento
- Fattore del tasso di variazione (F)
- X1 e X2 vengono "tradotti" in X1_end e X2_end il giorno Z da un fattore (F).
Ho provato a visualizzarlo nell'immagine allegata.
Molte grazie!
Progettazione di esperimentiRi: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentotutti buoni suggerimenti. Li controllerò tutti e li metterò l'uno contro l'altro una volta ottenuti i miei dati.
grazie mille per tutto l'aiuto
PS: In allegato c'è una visualizzazione del design (senza assi, ma ne hai capito il succo) 
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoIn Stima modello puoi specificare tutte le risposte nel ruolo Y. In questo caso dovrai adattare lo stesso modello (ad esempio il modello RSM completo) a tutte le risposte. In fondo al rapporto ci sarà un profiler con tutte le risposte insieme.
Oppure puoi adattare diversi modelli a ciascuna risposta e quindi salvarli come colonne Formula di previsione nella tabella. È quindi possibile profilare tutti questi - utilizzare Profiler dal menu Grafico.
Non ho provato il profiler spettrale in PLS. Penso che potrebbe funzionare. Darò un'occhiata se avrò tempo. Se hai la possibilità di provare, per favore fammi sapere se funziona.
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoQuesto mi porta ad altri aspetti pratici:
C'è un modo semplice per concatenare le analisi da ogni punto temporale insieme in una finestra del profiler? Ad esempio, esiste un'opzione per caricare direttamente modelli ridotti da ciascun punto temporale in un profiler spettrale?
molte grazie
PS: sto cercando di darvi tutti i miei complimenti, ma i pulsanti non funzionano per me.
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoIl mio pensiero originale era semplicemente quello di prendere ogni punto temporale e analizzare rispetto ai miei fattori così come sono al punto temporale - e poi concatenare tutte le analisi alla fine. Ma ho pensato che potesse esserci un modo più semplice per farlo. Ma visto che me lo suggerisci penso che ci riconsidererò! Eccezionale
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoCiao Phil,
Ognuna delle corse dell'esperimento è un bioreattore che esegue un intero feed-batch, quindi sì, una corsa completamente nuova ogni volta. Tutti i bioreattori sono programmabili e i fattori di alimentazione sono l'esecuzione di un'equazione risultante in un volume assoluto (che posso analizzare come volume-%).
Alle altre tue domande:
Tutte le impostazioni possibili hanno senso? Sì, tutti lo fanno e tutti sono interessanti per me.
Tutte le impostazioni sono fattibili? Sì, ho selezionato intervalli per soddisfare ciò che è possibile su questo particolare sistema (e per il futuro ridimensionamento).
Puoi interpretare l'effetto dei cambiamenti nei fattori in un modo che abbia senso per l'obiettivo dell'esperimento? Lo spero: in linea di principio posso calcolare la produttività di ogni cella e vedere come cambia nel tempo. Quindi spero di correlarlo a come il feed sta cambiando nel tempo (per esempio).
Consiglierei di simulare alcuni dati di risposta per verificarlo ( blog sulle risposte simulate ). Verificherò, grazie!
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoMi viene in mente che l'aspetto complicato di ciò è che tutti i fattori potrebbero essere attivi per la risposta al punto finale, ma alcuni fattori non sono rilevanti per la risposta in punti temporali precedenti (prima del cambiamento in X1 e X2). Non penso che questo sia un problema per come si progetta l'esperimento. È qualcosa a cui dovrai pensare per l'analisi. Prima di analizzare l'intera curva con PLS potresti voler analizzare ogni punto temporale come una risposta separata per verificare che abbia senso.
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoCiao,
Questo è molto interessante. Grazie per la condivisione.
Non vedo alcun problema con l'esperimento che hai proposto.
Da quello che ho capito, ciascuna delle esecuzioni dell'esperimento è un'esecuzione completamente nuova del processo. Le cose si complicano quando non è così e devi considerare fattori difficili da cambiare.
Pensa a come sarà il modello alla fine. Immagina il profiler di previsione che otterrai (ad esempio sotto). Tutte le impostazioni possibili hanno senso? Tutte le impostazioni sono fattibili? Puoi interpretare l'effetto dei cambiamenti nei fattori in un modo che abbia senso per l'obiettivo dell'esperimento? Consiglierei di simulare alcuni dati di risposta per verificarlo ( blog sulle risposte simulate ).
Saluti,
Fil
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoCiao Ian, posso farlo. L'esperimento è una coltura cellulare fed-batch: la risposta è una curva di concentrazione della proteina che le cellule stanno producendo (e il valore finale).
Lo scopo dell'esperimento è quello di ottimizzare la concentrazione proteica variando due alimentazioni (X1 e X2). Le concentrazioni di mangime verranno modificate in un "giorno di modifica" in X1_end e X2_end (ho deciso di non includere il "fattore di modifica (F)" precedentemente menzionato).
I mangimi vengono consegnati alla coltura cellulare una volta al giorno durante il fed-batch e contengono vari nutrienti. Ogni feed viene fornito da una % e può essere trattato come una variabile continua. Anche il giorno del cambiamento è una variabile continua. Tutti i fattori sono facili da cambiare. Poiché le cellule stanno crescendo e hanno cambiamenti metabolici durante il feed-batch, avranno bisogno di quantità diverse di alimenti (complessi) in momenti diversi durante la coltura. Non so cosa possa o meno essere limitante nei feed in questo momento, ma so che gli intervalli che sto esaminando sono rilevanti.
La mia domanda è: è anche possibile includere 5 fattori continui quando ciascuno di essi è attivo solo per un certo periodo durante l'esperimento? Come devo trattare i fattori che cambiano livello durante l'esperimento? Esiste una regola generale?
Se traccio in 5 fattori continui &RS nell'editor DoE personalizzato, ottengo 28 esperimenti consigliati da eseguire, il che è OK (vedi allegato). Suppongo anche che non tutti i fattori siano attivi. Il potere non è impressionante in questo esperimento, ma sono in grado di aumentarlo, se necessario. Una volta che ho i dati posso fare l'analisi sul timepoint finale, ma voglio anche l'opzione per eseguire PLS sulla curva di concentrazione rispetto ai miei fattori nel tempo.
Potrei essere fuori strada Ed è per questo che sono qui.
Spero che questo chiarisca un po' le cose
Grazie!
Ri: Custom DoE (RSM) con variabili che cambiano livello durante l'esperimentoSenza rivelare segreti commerciali, puoi dire qualcosa in più su cosa sono i fattori X1 e X2, per favore? Inoltre, alcuni dettagli in più su quale sia la risposta e su ciò che speri di imparare dall'esperimento sarebbero utili.
In DoE, manipoli attivamente i livelli dei fattori scelti per imparare qualcosa di specifico. Utilizzando 'difficile' e 'molto difficile' per modificare i fattori è possibile gestire situazioni in cui l'impostazione sperimentale impone che il cambiamento tra i livelli di fattore abbia alcune restrizioni. Ho la sensazione che questo potrebbe essere quello che stai cercando di fare, ma non sono sicuro da quello che hai scritto.
