DoE personnalisé (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceSalut la communauté,
J'essaie de concevoir une expérience de surface de réponse, mais je ne sais pas comment inclure des variables qui changent de niveau au cours de l'expérience. Comment tracer des variables avec des niveaux changeants dans l'éditeur DoE personnalisé ?
Contraintes:
- 24 expériences en 1 bloc (je ne sais pas si possible)
- L'expérience se déroule sur 16 jours avec des points d'échantillonnage tous les jours (avec une courbe de réponse (Y) comme résultat)
- Conception de surface de réponse à 4 variables (toutes continues avec 3 niveaux : -1, 0, 1) :
- X1 (-> X1_end le jour du changement)
- X2 (-> X2_end le jour du changement)
- Jour du changement
- Facteur de taux de changement (F)
- X1 et X2 sont « traduits » en X1_end et X2_end le jour Z par un facteur (F).
J'ai essayé de le visualiser sur l'image ci-jointe.
Merci beaucoup!
Conception d'expériencesRe : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expériencetoutes les bonnes suggestions. Je vais tous les vérifier et les comparer les uns aux autres une fois que j'aurai obtenu mes données.
merci beaucoup pour toute l'aide
PS: Ci-joint une visualisation du design (sans axes, mais vous en avez le sens) 
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceDans Fit Model, vous pouvez spécifier toutes les réponses dans le rôle Y. Dans ce cas, vous devrez ajuster le même modèle (par exemple, le modèle RSM complet) à toutes les réponses. Au bas du rapport sera un profileur avec toutes les réponses ensemble.
Ou vous pouvez adapter différents modèles à chaque réponse, puis les enregistrer en tant que colonnes de formule de prédiction dans le tableau. Vous pouvez ensuite profiler tous ces éléments - utilisez Profiler dans le menu Graph.
Je n'ai pas essayé le profileur spectral dans PLS. Je pense que ça pourrait marcher. Je vais regarder si j'ai le temps. Si vous avez la chance d'essayer, pouvez-vous s'il vous plaît laissez-moi savoir si cela fonctionne.
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceCela m'amène à d'autres aspects pratiques :
Existe-t-il un moyen simple de concaténer les analyses de chaque point temporel dans une fenêtre de profileur ? Existe-t-il une option pour charger directement des modèles réduits à partir de chaque point temporel dans un profileur spectral, par exemple ?
merci beaucoup
PS : J'essaie de vous remercier tous, mais les boutons ne fonctionnent pas pour moi.
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceMa pensée initiale était simplement de prendre chaque point dans le temps et d'analyser par rapport à mes facteurs tels qu'ils sont au point dans le temps - puis de concaténer toutes les analyses à la fin. Mais je pensais qu'il y avait peut-être un moyen plus simple de le faire. Mais puisque vous le suggérez, je pense que je vais reconsidérer! Impressionnant
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceSalut Phil,
Chacune des exécutions de l'expérience est un bioréacteur exécutant un fed-batch complet - donc oui, une exécution entièrement nouvelle à chaque fois. Tous les bioréacteurs sont programmables et les facteurs d'alimentation sont l'exécution d'une équation résultant en un volume absolu (que je peux analyser en volume-%).
A tes autres questions :
Tous les paramètres possibles ont-ils un sens ? Oui - tous le font et tous sont intéressants pour moi.
Tous les réglages sont-ils réalisables ? Oui - J'ai sélectionné des gammes pour tenir compte de ce qui est possible sur ce système particulier (et pour une mise à l'échelle future).
Pouvez-vous interpréter l'effet des changements dans les facteurs d'une manière cohérente avec l'objectif de l'expérience ? J'espère que oui - en principe, je peux calculer la productivité de chaque cellule et voir comment cela change avec le temps. J'espère donc corréler cela à la façon dont le flux évolue dans le temps (par exemple).
Je recommanderais de simuler certaines données de réponse pour vérifier cela ( blog sur les réponses simulées ). Je vais vérifier, merci !
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceIl me semble que l'aspect qui complique cela est que tous les facteurs pourraient être actifs pour la réponse au point final, mais certains facteurs ne sont pas pertinents pour la réponse à des moments antérieurs (avant le changement de X1 et X2). Je ne pense pas que ce soit un problème pour la façon dont vous concevez l'expérience. C'est quelque chose auquel vous devrez penser pour l'analyse. Avant d'analyser l'ensemble de la courbe avec PLS, vous souhaiterez peut-être analyser chaque point dans le temps comme une réponse distincte pour vérifier que cela a du sens.
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceSalut,
C'est très intéressant. Merci d'avoir partagé.
Je ne vois aucun problème avec l'expérience que vous proposez.
D'après ce que je comprends, chacune des exécutions de l'expérience est une toute nouvelle exécution du processus. Les choses se compliquent lorsque ce n'est pas le cas et vous devez tenir compte de facteurs difficiles à modifier.
Réfléchissez à ce à quoi ressemblera le modèle à la fin. Imaginez le profileur de prédiction que vous obtiendrez (par exemple ci-dessous). Tous les paramètres possibles ont-ils un sens ? Tous les réglages sont-ils réalisables ? Pouvez-vous interpréter l'effet des changements dans les facteurs d'une manière cohérente avec l'objectif de l'expérience ? Je recommanderais de simuler certaines données de réponse pour vérifier cela ( blog sur les réponses simulées ).
Salutations,
Phil
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceSalut Ian, je peux le faire. L'expérience est une culture cellulaire fed-batch : la réponse est une courbe de concentration de la protéine que les cellules produisent (et la valeur finale).
Le but de l'expérience est d'optimiser la concentration en protéines en faisant varier deux aliments (X1 et X2). Les concentrations d'aliments seront changées un 'jour de changement' en X1_end et X2_end (j'ai décidé de ne pas inclure le 'facteur de changement (F)' précédemment mentionné).
Les aliments sont livrés à la culture cellulaire une fois par jour pendant le fed-batch et contiennent divers nutriments. Chaque flux est délivré par un % et peut être traité comme une variable continue. Le jour du changement est également une variable continue. Tous les facteurs sont faciles à modifier. Étant donné que les cellules se développent et ont des changements métaboliques pendant le fed-batch, elles auront besoin de différentes quantités d'aliments (complexes) à différents moments de la culture. Je ne sais pas ce qui peut ou non être limité dans les flux à ce stade, mais je sais que les plages que j'examine sont pertinentes.
Ma question est la suivante : est-il même possible d'inclure 5 facteurs continus lorsque chacun d'eux n'est actif que pendant une certaine période au cours de l'expérience ? Comment dois-je traiter les facteurs dont les niveaux changent au cours de l'expérience ? Existe-t-il une règle générale ?
Si je trace en 5 facteurs continus & RS dans l'éditeur DoE personnalisé, j'obtiens 28 expériences recommandées à effectuer, ce qui est OK (voir pièce jointe). Je suppose également que tous les facteurs ne sont pas actifs. La puissance n'est pas impressionnante sur cette expérience, mais je suis capable de l'augmenter, si nécessaire. Une fois que j'ai les données, je peux faire l'analyse sur le point de temps final - mais je veux aussi l'option d'effectuer PLS sur la courbe de concentration par rapport à mes facteurs au fil du temps.
Je suis peut-être loin Et c'est pourquoi je suis ici.
J'espère que cela clarifie un peu les choses
Merci!
Re : Custom DoE (RSM) avec des variables qui changent de niveau pendant l'expérienceSans révéler de secrets commerciaux, pouvez-vous en dire un peu plus sur les facteurs X1 et X2, s'il vous plaît ? En outre, il serait bon d'avoir plus de détails sur la réponse et sur ce que vous espérez apprendre de l'expérience.
Dans DoE, vous manipulez activement les niveaux des facteurs choisis pour apprendre quelque chose de spécifique. En utilisant « difficile » et « très difficile » pour modifier les facteurs, vous pouvez gérer les situations dans lesquelles la configuration expérimentale dicte que le changement entre les niveaux de facteur a certaines restrictions. J'ai l'impression que c'est peut-être ce que vous essayez de faire, mais je ne suis pas sûr de ce que vous avez écrit.
