Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, deren Niveau sich während des Experiments ändertHallo Community,
Ich versuche, ein Reaktionsflächenexperiment zu entwerfen, bin mir aber nicht sicher, wie ich Variablen einbeziehen kann, deren Niveau sich während des Experiments ändert. Wie zeichne ich Variablen mit sich ändernden Niveaus im benutzerdefinierten DoE-Editor auf?
Einschränkungen:
- 24 Experimente in einem Block (nicht sicher, ob möglich)
- Das Experiment läuft über 16 Tage mit täglichen Probenahmepunkten (mit einer Antwortkurve (Y) als Ergebnis)
- Response-Surface-Design mit 4 Variablen (alle kontinuierlich mit 3 Niveaus: -1, 0, 1):
- X1 (-> X1_Ende am Tag der Änderung)
- X2 (-> X2_Ende am Tag der Änderung)
- Tag der Veränderung
- Änderungsratenfaktor (F)
- X1 und X2 werden am Tag Z mit einem Faktor (F) in X1_end und X2_end „übersetzt“.
Ich habe versucht, es im beigefügten Bild zu visualisieren.
Vielen Dank!
VersuchsplanungBetreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernalles gute vorschläge. Ich werde sie alle prüfen und miteinander vergleichen, sobald ich meine Daten habe.
vielen Dank für all die Hilfe
PS: Im Anhang ist eine Visualisierung des Designs (ohne Achsen, aber Sie bekommen den Überblick) 
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernIn Modell anpassen können Sie entweder alle Antworten in der Y-Rolle angeben. In diesem Fall müssen Sie dasselbe Modell (z. B. das vollständige RSM-Modell) an alle Antworten anpassen. Am Ende des Berichts befindet sich ein Profiler mit allen Antworten zusammen.
Oder Sie passen verschiedene Modelle an jede Antwort an und speichern sie dann als Vorhersageformelspalten in der Tabelle. Sie können dann alle diese Profile profilieren - verwenden Sie den Profiler aus dem Diagrammmenü.
Ich habe den Spectral Profiler in PLS nicht ausprobiert. Ich denke, das könnte funktionieren. Ich werde mal schauen, wenn ich Zeit finde. Wenn Sie Gelegenheit haben, es zu versuchen, können Sie mir bitte mitteilen, ob es funktioniert.
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernDies bringt mich zu einigen anderen praktischen Aspekten:
Gibt es eine einfache Möglichkeit, Analysen von jedem Zeitpunkt in einem Profilerfenster zu verketten? Gibt es eine Möglichkeit, reduzierte Modelle von jedem Zeitpunkt zum Beispiel direkt in einen Spektralprofiler zu laden?
Danke vielmals
PS: Ich versuche, euch allen ein dickes Lob auszusprechen, aber die Schaltflächen funktionieren bei mir nicht.
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernMein ursprünglicher Gedanke war, einfach jeden Zeitpunkt zu nehmen und in Bezug auf meine Faktoren zu analysieren, wie sie zum Zeitpunkt sind – und dann alle Analysen am Ende zu verketten. Aber ich dachte, dass es einen einfacheren Weg geben könnte. Aber da du es vorschlägst, denke ich, ich werde es mir noch einmal überlegen! Genial
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernHallo Phil,
Jeder der Läufe im Experiment ist ein Bioreaktor, der eine volle Fed-Batch läuft – also ja, jedes Mal ein völlig neuer Lauf. Alle Bioreaktoren sind programmierbar und die Zufuhrfaktoren sind die Ausführung einer Gleichung, die zu einem absoluten Volumen führt (das ich als Volumenprozent analysieren kann).
Zu deinen anderen Fragen:
Sind alle möglichen Einstellungen sinnvoll? Ja - alle tun und alle sind interessant für mich.
Sind alle Einstellungen machbar? Ja – ich habe Bereiche ausgewählt, um dem Rechnung zu tragen, was auf diesem speziellen System möglich ist (und für eine zukünftige Aufwärtsskalierung).
Können Sie die Auswirkungen von Änderungen der Faktoren so interpretieren, dass sie für das Ziel des Experiments sinnvoll sind? Ich hoffe es – im Prinzip kann ich die Produktivität jeder Zelle berechnen und sehen, wie sich diese im Laufe der Zeit verändert. Ich hoffe also, das damit in Beziehung setzen zu können, wie sich der Feed im Laufe der Zeit verändert (zum Beispiel).
Ich würde empfehlen, einige Antwortdaten zu simulieren, um dies zu überprüfen ( Blog über Antworten simulieren ). Ich werde es überprüfen, danke!
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernMir scheint, dass der erschwerende Aspekt dabei darin besteht, dass alle Faktoren für die Reaktion am Endpunkt aktiv sein könnten, aber einige Faktoren für die Reaktion zu früheren Zeitpunkten (vor der Änderung von X1 und X2) nicht relevant sind. Ich glaube nicht, dass dies ein Problem für die Gestaltung des Experiments ist. Es ist etwas, worüber Sie für die Analyse nachdenken müssen. Bevor Sie die gesamte Kurve mit PLS analysieren, sollten Sie jeden Zeitpunkt als separate Antwort analysieren, um zu überprüfen, ob er sinnvoll ist.
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernHi,
Das ist sehr interessant. Danke für das Teilen.
Ich sehe kein Problem mit dem Experiment, das Sie vorgeschlagen haben.
Soweit ich weiß, ist jeder Durchlauf des Experiments ein völlig neuer Durchlauf des Prozesses. Die Dinge werden komplizierter, wenn dies nicht der Fall ist, und Sie müssen schwer zu ändernde Faktoren berücksichtigen.
Überlegen Sie, wie das Modell am Ende aussehen wird. Stellen Sie sich den Vorhersageprofiler vor, den Sie erhalten (zB unten). Sind alle möglichen Einstellungen sinnvoll? Sind alle Einstellungen machbar? Können Sie die Auswirkungen von Änderungen der Faktoren so interpretieren, dass sie für das Ziel des Experiments sinnvoll sind? Ich würde empfehlen, einige Antwortdaten zu simulieren, um dies zu überprüfen ( Blog über Antworten simulieren ).
Grüße,
Phil
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernHallo Jan, das kann ich. Das Experiment ist eine Fed-Batch-Zellkultur: Die Antwort ist eine Konzentrationskurve des Proteins, das die Zellen produzieren (und der Endwert).
Ziel des Experiments ist es, die Proteinkonzentration durch Variation zweier Futtermittel (X1 und X2) zu optimieren. Die Futterkonzentrationen werden an einem „Änderungstag“ auf X1_Ende und X2_Ende geändert (ich habe mich entschieden, den zuvor erwähnten „Änderungsfaktor (F)“ nicht einzubeziehen).
Die Feeds werden der Zellkultur einmal täglich während des Fed-Batches zugeführt und enthalten verschiedene Nährstoffe. Jeder Feed wird in % geliefert und kann als kontinuierliche Variable behandelt werden. Der Tag der Änderung ist ebenfalls eine kontinuierliche Variable. Alle Faktoren sind einfach zu ändern. Da die Zellen wachsen und während des Fed-Batches Stoffwechselverschiebungen erfahren, benötigen sie zu unterschiedlichen Zeitpunkten während der Kultur unterschiedliche Mengen der (Komplex-)Nahrung. Ich weiß nicht, was in den Feeds zu diesem Zeitpunkt einschränkend sein könnte oder nicht, aber ich weiß, dass die Bereiche, die ich untersuche, relevant sind.
Meine Frage ist: Ist es überhaupt möglich, 5 kontinuierliche Faktoren einzubeziehen, wenn jeder von ihnen nur für einen bestimmten Zeitraum während des Experiments aktiv ist? Wie soll ich Faktoren behandeln, die sich während des Experiments ändern? Gibt es eine allgemeine Faustregel?
Wenn ich im benutzerdefinierten DoE-Editor 5 kontinuierliche Faktoren &RS einzeichne, erhalte ich 28 empfohlene Experimente zur Durchführung, was in Ordnung ist (siehe Anhang). Ich gehe auch davon aus, dass nicht alle Faktoren aktiv sind. Die Leistung ist bei diesem Experiment nicht beeindruckend, aber ich kann sie bei Bedarf steigern. Sobald ich die Daten habe, kann ich die Analyse zum endgültigen Zeitpunkt durchführen - aber ich möchte auch die Möglichkeit haben, PLS auf der Konzentrationskurve im Vergleich zu meinen Faktoren im Laufe der Zeit durchzuführen.
Ich könnte weit weg sein Und deshalb bin ich hier.
Ich hoffe, das klärt die Sache ein wenig auf
Danke!
Betreff: Benutzerdefiniertes DoE (RSM) mit Variablen, die sich während des Experiments ändernKönnen Sie bitte, ohne Betriebsgeheimnisse preiszugeben, etwas mehr darüber sagen, was die Faktoren X1 und X2 sind? Außerdem wären einige weitere Details darüber, wie die Reaktion ist und was Sie aus dem Experiment zu lernen hoffen, gut.
In DoE manipulieren Sie aktiv die Ebenen der ausgewählten Faktoren, um etwas Bestimmtes zu lernen. Indem Sie „hart“ und „sehr schwer“ verwenden, um Faktoren zu ändern, können Sie Situationen handhaben, in denen der experimentelle Aufbau vorschreibt, dass der Wechsel zwischen Faktorstufen einigen Einschränkungen unterliegt. Ich habe das Gefühl, dass dies das sein könnte, was Sie versuchen, aber ich bin mir nicht sicher, was Sie geschrieben haben.
