¿Prueba de Friedman en JMP?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Estimados,
Soy bastante nuevo en el uso de JMP software, y por lo que puedo ver, no hay ninguna función en el programa para usar el prueba de Friedman ? Tengo una distribución no normal de mis diferentes conjuntos de valores (más de tres grupos) y estoy optando por una prueba no paramétrica . Es decir, me gustaría probar un tipo de prueba de 2 vías (como ANOVA). prueba de wilcoxon es insuficiente ya que es una prueba unidireccional.
¿Alguien sabe cómo solucionaré este problema? ¿Existe alguna otra prueba que realizar en lugar de la prueba de Friedman?
Atentamente,
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Sí, una limitación de la prueba de Friedman y de CUALQUIER prueba con bloqueo es que la variable de bloqueo no interactúa con el factor.
Para ampliar esto, supongamos que tiene 10 bloques y 3 tratamientos. Con el enfoque de Friedman, estás calculando rangos dentro de cada bloque. Los rangos dentro de cada bloque siempre sumarán 6. Por lo tanto, cuando realices la prueba no habrá ninguna diferencia entre los bloques (las sumas de los cuadrados serán 0 para el efecto de bloque).
Si SÍ realizó una interacción (que podría probar dentro de JMP, solo necesita usar Ajustar modelo en lugar de Ajustar Y por X), tendría 9 DF para los bloques, 2 DF para el tratamiento y 18 DF para el interacción. Te quedan 0 DF por error. Tiene un modelo saturado y no habrá pruebas disponibles.
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Me doy cuenta de que esta es una discusión antigua, pero la encontré de gran ayuda. He podido implementarlo con éxito pero tengo la siguiente pregunta:
Para evaluar el impacto de ambas variables en la variable de resultado, supongo que se deben probar cada una por separado, utilizando rangos creados usando ambas, pero alternándolas entre roles de bloqueo y dependientes. Sin embargo, ¿cómo se determina la interacción entre estas dos variables? Afortunadamente pude transformar mis datos con éxito y realizar un ANOVA bidireccional utilizando la plataforma Fit Model. ¿Es esta una limitación de la prueba de Friedman?
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hola Maria,
Te refieres a usar Fit Model para rangos para realizar el análisis de RM. Sin embargo, en las últimas publicaciones vi usar Fit Y by X para calcular los bloques. Quizás necesito hacerlo primero y luego ir a Fit Model. Según tengo entendido, RM solo se puede evaluar en el modelo de ajuste.
Gracias.
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Una vez que tenga los rangos, esencialmente estará realizando medidas repetidas en los rangos, por lo que estará transformando los datos y realizando el análisis RM en los rangos. Eso es básicamente lo que hace una prueba de Friedmans bajo el capó.
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hola Maria,
Gracias por tu respuesta y enlace. Eché un vistazo a esas publicaciones, pero según entendí ese problema no se refería a un diseño de medidas repetidas, ¿verdad?
Cuando nos enfrentamos a un diseño de medidas repetidas, por lo general, los procedimientos estadísticos cambian debido a la peculiaridad de ese diseño.
Jeff ( @Jeff_Perkinson ), ¿tiene alguna sugerencia para solucionar este problema, por favor?
Muchas gracias.
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hice la misma pregunta y el soporte de JMP respondió esto, lo cual funciona
JMP tiene muchas pruebas no paramétricas integradas. La prueba de Friedman no está disponible directamente en JMP, pero puede transformar sus datos en rangos en JMP para crear esta prueba simplemente como un ANOVA bidireccional en los rangos (usando el factor de bloqueo y el otro factor como dos factores aditivos). Hay un blog sobre esto (y argumentando, al final, por qué es posible que no quieras la prueba de Friedman en algunos casos) aquí: https://community.jmp.com/t5/Discussions/Friedman-test-on-JMP/td-p/5974 .
Es un problema si tienes vínculos, por lo que puede que tus datos no sean normales en primer lugar. La gente a menudo olvida que, aunque las pruebas no paramétricas no asumen que los datos sean normales, estas pruebas todavía tienen suposiciones. Espero que esto haya ayudado
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hola,
¿Cómo puedo ejecutar la prueba de Friedman para un diseño de medidas repetidas, por favor?
Déjame saber los procedimientos de paso.
Gracias.
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Esto fue muy útil, pero cuando elegí guardar rangos, solo tengo aproximadamente la mitad de mis datos que tienen un rango.
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hola,
Me temo que no. Dejé la prueba hace algún tiempo. Pero puedo volver a investigarlo, ya que pronto tendré algunos datos nuevos que serán analizados estadísticamente. Actualizaré sobre este tema si Friedman vuelve a ser de interés.
Atentamente,
Jim
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?También recibo el error "Se ignoró el bloqueo porque el recuento de celdas era desigual" cuando intento hacer un ANOVA simple, a pesar de que todos mis bloques tienen el mismo número de observaciones.¿Alguna vez pudiste resolver esto?¡Gracias!
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?¡Hola de nuevo!
Sí, finalmente he dejado de lado las pruebas. Puede que más adelante pruebe la prueba de Friedman, pero en SPSS. Un colega mío me dijo que está intentando realizar la prueba de Friedman en SPSS.
Pero gracias por toda la ayuda y los buenos consejos.
Atentamente,
Jim
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Abandonar AHORA en la prueba de Friedman.Sólo se aplica cuando hay igual número de observaciones en cada bloque.Piénselo: considere dos bloques, uno con cinco observaciones y otro con diez.La media del primer bloque es 3, la del segundo 5,5. Automáticamente tienes una diferencia, por lo que la hipótesis nula no puede ser cierta, por lo que cualquier valor de p es, bueno, falso.Esto significa que no puedes simplemente clasificar, transformar tus datos por bloque y obtener algo significativo.JMP le protege de hacer esto y emite el mensaje de error.
Así que es hora de detenerse y reconsiderar su enfoque de análisis.Dices que tienes datos anormales.Puede ser, pero los supuestos de ANOVA son que los errores se distribuyen normalmente.¿Los has examinado?¿Cómo se ve la distribución de errores?¿Es susceptible de transformación?Probablemente sea hora de consultar con alguien cara a cara para intentar responder estas preguntas.Luego, se puede diseñar un plan de análisis apropiado.
Steve Denham
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?¡Hola de nuevo!
Gracias. Desafortunadamente, todavía no lo he solucionado. Sin embargo, tal vez necesite rehacer los rangos (análisis de distribución para guardar rangos), ya que cuando ejecuto Fit y by x-analyses aparece una publicación que dice "Se ignoró el bloqueo porque el recuento de celdas no era igual". Después de eso, excluí algunas réplicas que contenían algunas celdas vacías pensando que esta podría ser la razón de la desigualdad, las guardé como rangos y las ejecuté en forma y por x, pero la desigualdad aún permanece y la publicación aparece nuevamente). ¿Podría ser que hay algunas especies que tienen 6 réplicas y ahora algunas tienen 5 réplicas? Sin embargo, todas las réplicas son iguales en número de muestras tratadas (es decir, control y tratadas). ¿Esto plantea un problema para realizar la prueba de Friedman?
En mis ejecuciones de Fit y by x utilicé, en el modelo de especificación, los valores de rasgo como respuesta Y, y el tratamiento y número de bloque para el factor X y el bloque. Incluso cambié el tratamiento y el número de bloque para esas dos especificaciones. Pero además de recibir el signo de publicación mencionado anteriormente, no mostró ningún dato ni relevancia (valores p de ANOVA bidireccional, por ejemplo).
También. Hasta ahora. El archivo de salida resultante no muestra (nunca) ningún dato ANOVA bidireccional, sino que el archivo de salida (como siempre) tiene el título ANOVA unidireccional. ¿Cómo puede saber exactamente si su prueba de Friedman se muestra o no en el archivo de salida? No creo que haya un título que diga, por ejemplo, ANOVA bidireccional no paramétrico en el ajuste de salida y por x.
Si alguien tiene alguna idea sobre esto, ¡escríbanos una o dos líneas! No me rendiré con este (todavía).
Atentamente,
Jim
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?¡Oye!
Gracias por toda la ayuda. Me meteré en el asunto y espero poder solucionarlo pronto. Volveré con algunos resultados que espero sean exitosos.
Perdón por responder tarde, estoy ocupado con algunos trabajos de laboratorio.
Atentamente,
Jim
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hola Jim,
Debe especificar su variable de bloqueo en la función Bloquear en el cuadro de diálogo Ajustar Y por X:
-Jeff
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Para X, debe especificar tanto el tratamiento como el bloqueo (pero no su interacción) para obtener la prueba de Friedman.
Steve Denham
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Muchas gracias Jeff. Sin embargo, no estoy seguro de haber encontrado lo que busco: ANOVA de 2 vías. Parece que al final recibo solo datos ANOVA unidireccionales en el archivo de salida. Esto es lo que hice: primero, realicé análisis de distribución y clasifiqué los datos transformados de uno de los rasgos que he estudiado (Y) de acuerdo con su diseño de bloques aleatorios, es decir, bloques (By). Los datos se guardaron como rangos (seis datos de rango/bloque compilados en una columna de la hoja de datos de Jmp) y luego analicé el rasgo transformado por rango con Ajustar Y por X: Y como datos de rango, y para XI utilicé el tratamiento como variable. . Sin embargo, en el archivo de salida solo veo datos ANOVA unidireccionales.
¿Se ha llevado a cabo de manera incorrecta? ¿O los datos se encontrarán en algún lugar dentro del archivo de salida?
¡Agradecido por los aportes en este asunto!
Atentamente,
Jim
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Hola Jim,
La prueba de Friedman no es compatible directamente con JMP pero, como señala Steve, puede hacerlo calculando los rangos dentro de cada bloque y luego haciendo un ANOVA bidireccional en los rangos usando Fit Y by X (tratando uno de los efectos como una variable de bloqueo) .
Calcular los rangos dentro del bloque es fácil en JMP. Simplemente use la plataforma de Distribución con su respuesta original como Y y su variable de bloqueo como Por variable. Luego, en el informe resultante, mantenga presionada la tecla Ctrl y haga clic en el pequeño triángulo rojo en la parte superior de uno de los histogramas y elija Guardar->Clasificaciones. Obtendrá una nueva columna en su tabla de datos con los rangos dentro de los niveles de su variable de bloqueo.
¡Espero que eso ayude!
-Jeff
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Gracias por la ayuda. Aunque la prueba de Friedman no parece aparecer en el menú de JMP ni en ninguna otra parte del programa. Quizás necesite realizarlo en SAS si JMP no realiza estas pruebas.
Atentamente,
Jim
Re: ¿Prueba de Friedman en JMP?Si no puede encontrar la prueba de Friedman en los menús (y no tengo idea de si puede o no, ya que no soy un usuario de JMP), puede clasificar, transformar sus datos y usar un ANOVA de dos vías en las clasificaciones. .En SAS, esto está disponible en PROC FREQ, por lo que consultaría la documentación de JMP para conocer la posibilidad de realizar la prueba de Friedman de esa manera.
Steve Denham
