Domanda sulle misure ripetute con più variabili continueCiao a tutti,
Sono un nuovo utente di JMP (e per niente un esperto di statistica!) con una domanda sulle misure ripetute. Ho un set di dati con 10 soggetti, ognuno dei quali è stato misurato tra 4 e 6 volte per diverse settimane, prima e dopo l'esposizione a un agente patogeno. Ad ogni punto di misurazione, è stato calcolato il potenziale di legame ed è stato ANCHE effettuato un emocromo completo (ci sono state anche un paio di volte in cui è stato effettuato un emocromo completo in assenza di potenziale di legame). Quello che speriamo di scoprire è quali variabili nel CBC sono maggiormente associate ai cambiamenti nel potenziale di legame. Poiché tutte le nostre variabili sono continue, non ho trovato un tutorial che corrisponda ai miei dati (quello dei cani non si adatta davvero). Non sono del tutto sicuro di come fare in modo che JMP esamini ogni animale separatamente (o se è necessario farlo) e di come fare in modo che JMP tenga conto del fatto che i dati provengano da pre o post-esposizione. In questo momento ho organizzato i miei dati nel formato "alto" e non sono sicuro che funzionerebbe per crearne uno "largo" (o, almeno, risulterebbe in circa 200 colonne). Qualsiasi intuizione sarebbe davvero apprezzata.
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continueCiao Mark!
Grazie mille per aver lavorato con me! Sto facendo progressi.
Avevo una domanda su un altro aspetto di questa analisi. Da quello che ho capito, la funzione Animal ID [Random] ci fornisce intercettazioni casuali. C'è un modo per ottenere anche pendenze casuali (penso che si chiami coefficienti casuali, giusto?)? Credo che JMP Pro offra questo: posso farlo anche con una versione non professionale di JMP?Ho cercato di rispondere a questa domanda da solo, ma non sono stato in grado di farlo con certezza.
Ancora una volta, molte grazie per il tuo tempo!
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continueNon sono così sicuro ora che PLS sia la risposta. È un'analisi multivariata di dati numerici e devi includere Cane , che è categorico . Inoltre, il Cane effetto è casuale . Potresti invece considerare a modello a effetti misti , poiché il tuo studio potrebbe essere visto come a disegno a trama divisa in cui ogni cane è il intera trama . Ho impostato un semplice esempio:
Ovviamente non ho valori di risposta. ero solito CB 1 E CB 2 per rappresentare due dei conteggi - probabilmente ne hai di più. Trattiamo tutti i risultati CBC come fattori/predittori con effetti fissi. Selezionare Analizzare > Modello adatto e inserisci le colonne in questi ruoli:
Notare che Cane è indicato per avere un effetto casuale. (Selezionare Cane nell'elenco Effetti, fare clic sul triangolo rosso accanto a Attributi e selezionare Casuale .)
È possibile includere più termini nel predittore lineare, come altre colonne CBC o trasformazioni come interazioni o potenze, se necessario.
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continueSe ho capito bene, hai almeno due risposte nel tempo e vuoi studiare/testare/modellare la loro correlazione. Questo è esattamente ciò che PLS farà per te. Ti suggerisco di prendere il libro, " Alla scoperta dei minimi quadrati parziali con JMP ," che spiega PLS nel contesto della risoluzione di problemi reali (casi di studio). È un libro meraviglioso su questa importante tecnica.
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continueCiao Mark,
Scusa se sono stato poco chiaro! Ho preso due punti temporali di riferimento in momenti separati: 10 e 5 giorni prima dell'esposizione (motivo per cui inizialmente ho inserito i valori negativi). Gli altri punti temporali non hanno misurazioni duplicate. Regolerò entrambi i livelli di base del fattore "giorno dell'infezione" a 0. Partial Least Squares sembra interessante e ho giocato con le opzioni su JMP, ma non posso dire se terrà conto di misure ripetute.
Grazie mille per avermi sopportato!
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continueEsegui misurazioni duplicate in tutti i punti temporali (linea di base e dopo l'esposizione)?
Penso che il tuo fattore sia implicitamente incluso nel punto temporale (esposizione = no se il tempo è 0, esposizione = sì se il tempo> 0). puoi includere una colonna di dati per il fattore ma non sono sicuro che sia esplicitamente richiesto dall'analisi.
Perché il "giorno dell'infezione" dovrebbe essere negativo?' Monitorate giornalmente per 10 giorni prima dell'esposizione e poi giornalmente dopo? Pensavo avessi preso solo misurazioni di base (tempo = 0).
Credo che potresti utilizzare un modello PLS con tutte e 3 le risposte rispetto all'1 predittore, il tempo.
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continueGrazie mille per la tua risposta Marco! Esaminerò di più l'analisi dei minimi quadrati parziali.
Il fattore è l'esposizione, sì. Prima dell'esposizione abbiamo raccolto due punti temporali di riferimento.
In questo momento ho una colonna con ID soggetto, con diverse righe per ogni ID che rappresentano punti temporali diversi. Per il livello del fattore, potrebbe trattarsi di una variabile continua (ad es. giorni di infezione, dove il valore di riferimento è rappresentato da un numero negativo)? Ad esempio, questo è analogo a come sono organizzati i miei dati al momento, ma i numeri sono inventati:
| ID soggetto | Giorno dell'infezione (livello di fattore) | variabile x | Variabile Y | Variabile z |
| 1 | -10 | 1.5 | 5 | 0 |
| 1 | 2 | 6 | 5 | 0 |
| 1 | 10 | 8 | 1 | 2 |
| 2 | -10 | .7 | 6 | 0 |
| 2 | 2 | 2 | 7 | 2 |
| 2 | 10 | 5 | 3 | 4 |
| 3 | -10 | 1.2 | 4 | 1 |
| 3 | 2 | 6 | 1 | 4 |
Ri: Domanda su misure ripetute con più variabili continuePotrebbe esserci più di un modo per analizzare il tuo studio. Potremmo aver bisogno di più informazioni di base man mano che procediamo.
JMP può eseguire un'analisi delle misure ripetute diversi modi . Il fatto che tu sia interessato alla correlazione tra le risposte suggerisce che potrebbe essere utile anche l'analisi dei minimi quadrati parziali (PLS).
Quindi l'emocromo e il potenziale di legame sono entrambe risposte. C'è un fattore (esposizione). Hai studiato l'andamento temporale prima dell'esposizione o hai misurato solo una linea di base?
Avrai bisogno di una colonna per l'ID del soggetto e un'altra per il livello del fattore.
