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Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Hallo allerseits,

 

Ich bin ein neuer JMP-Benutzer (und überhaupt kein Statistikexperte!) und habe eine Frage zu wiederholten Messungen. Ich habe einen Datensatz mit 10 Probanden, die jeweils vier- bis sechsmal über mehrere Wochen gemessen wurden, vor und nach der Exposition gegenüber einem Krankheitserreger. An jedem Messpunkt wurde das Bindungspotential berechnet und AUCH ein großes Blutbild erstellt (einige Male wurde auch ein großes Blutbild ohne Bindungspotential erstellt). Wir hoffen herauszufinden, welche Variablen im CBC am stärksten mit Veränderungen des Bindungspotentials verbunden sind. Da alle unsere Variablen kontinuierlich sind, habe ich kein Tutorial gefunden, das zu meinen Daten passt (das Doge-Variable passt nicht wirklich). Ich bin mir nicht ganz sicher, wie ich JMP dazu bringen kann, jedes Tier einzeln zu betrachten (oder ob ich das tun muss) und wie ich dafür sorgen soll, dass JMP berücksichtigt, ob die Daten vor oder nach der Exposition stammen. Im Moment habe ich meine Daten im „großen“ Format organisiert und bin mir nicht sicher, ob es funktionieren würde, ein „breites“ Format zu erstellen (oder zumindest etwa 200 Spalten ergeben würde). Jeder Einblick wäre wirklich dankbar.

 

 

 

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Hallo Mark!

 

Vielen Dank für die Zusammenarbeit! Ich mache Fortschritte.

 

Ich hatte eine Frage zu einem anderen Aspekt dieser Analyse. Soweit ich weiß, liefert uns die Funktion „Animal ID [Random]“ zufällige Abschnitte. Gibt es eine Möglichkeit, auch zufällige Steigungen zu erhalten (ich glaube, das nennt man Zufallskoeffizienten, oder?)? Ich glaube, dass JMP Pro dies bietet – kann ich dies auch mit einer Nicht-Pro-Version von JMP tun?Ich habe versucht, diese Frage selbst zu beantworten, konnte es aber nicht mit Sicherheit.  

 

Nochmals vielen Dank für Ihre Zeit!

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Ich bin mir jetzt nicht mehr so sicher, ob PLS die Antwort ist. Es handelt sich um eine multivariate Analyse von numerische Daten und Sie müssen einschließen Hund , welches ist kategorisch . Darüber hinaus ist die Hund Wirkung ist willkürlich . Sie könnten stattdessen a in Betracht ziehen Mixed-Effects-Modell , wie Ihre Studie als angesehen werden könnte Split-Plot-Design in dem jeder Hund der ist ganze Handlung . Ich habe ein einfaches Beispiel erstellt:

Ich habe offensichtlich keine Antwortwerte. ich benutzte CBC 1 Und CBC 2 um zwei der Zählungen darzustellen – Sie haben wahrscheinlich mehr. Behandeln wir alle CBC-Ergebnisse als Faktoren/Prädiktoren mit festen Auswirkungen. Wählen Analysieren > Modell anpassen und tragen Sie die Spalten in diese Rollen ein:

Beachte das Hund Es wird angegeben, dass es einen zufälligen Effekt hat. (Wählen Hund Klicken Sie in der Liste „Effekte“ auf das rote Dreieck neben Attribute , und wählen Sie Willkürlich .)

Sie können nach Bedarf weitere Terme in den linearen Prädiktor aufnehmen, z. B. andere CBC-Spalten oder Transformationen wie Wechselwirkungen oder Potenzen.

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Wenn ich Sie richtig verstehe, haben Sie im Laufe der Zeit mindestens zwei Antworten und möchten deren Korrelation untersuchen/testen/modellieren. Genau das erledigt PLS für Sie. Ich schlage vor, dass Sie sich das Buch besorgen“, Entdecken partieller kleinster Quadrate mit JMP “, das PLS im Kontext der Lösung realer Probleme (Fallstudien) erklärt. Es ist ein wunderbares Buch über diese wichtige Technik.

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Hallo Mark,

 

Tut mir leid, wenn ich unklar war! Ich habe zwei Basiszeitpunkte zu unterschiedlichen Zeitpunkten gemessen: 10 und 5 Tage vor der Exposition (weshalb ich zunächst die negativen Werte angegeben habe). Zu den anderen Zeitpunkten gibt es keine doppelten Messungen. Ich werde beide Grundfaktorwerte für den „Infektionstag“ auf 0 setzen. „Partial Least Squares“ sieht interessant aus und ich habe mit den Optionen in JMP herumgespielt, aber ich kann nicht sagen, ob es wiederholte Messungen berücksichtigt.

 

Vielen Dank, dass Sie mit mir geduldet haben!

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Führen Sie zu jedem Zeitpunkt (zu Beginn und nach der Exposition) doppelte Messungen durch?

Ich denke, dass Ihr Faktor implizit im Zeitpunkt enthalten ist (Belichtung = Nein, wenn die Zeit 0 ist, Belichtung = Ja, wenn die Zeit > 0 ist). Sie können eine Datenspalte für den Faktor einfügen, ich bin mir jedoch nicht sicher, ob dies für die Analyse ausdrücklich erforderlich ist.

Warum sollte „Infektionstag“ negativ sein? Überwachen Sie 10 Tage lang täglich vor der Exposition und dann täglich danach? Ich dachte, Sie hätten nur Basismessungen durchgeführt (Zeit = 0).

Ich glaube, dass Sie ein PLS-Modell mit allen drei Antworten gegenüber dem einen Prädiktor, der Zeit, verwenden könnten.

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Vielen Dank für deine Antwort, Mark! Ich werde mir die partielle Analyse der kleinsten Quadrate genauer ansehen.

 

Der Faktor ist die Belichtung, ja. Vor der Exposition haben wir zwei Basiszeitpunkte erfasst.

 

Im Moment habe ich eine Spalte mit der Betreff-ID, wobei mehrere Zeilen für jede ID unterschiedliche Zeitpunkte darstellen. Könnte es sich bei der Faktorstufe um eine kontinuierliche Variable handeln (z. B. Tage der Infektion, wobei der Ausgangswert als negative Zahl dargestellt wird)? Das ist zum Beispiel analog dazu, wie meine Daten im Moment organisiert sind, aber die Zahlen setzen sich zusammen:

 

Betreff-ID	Infektionstag (Faktorebene)	Variable x	Variable y	Variable z
1	-10	1.5	5	0
1	2	6	5	0
1	10	8	1	2
2	-10	.7	6	0
2	2	2	7	2
2	10	5	3	4
3	-10	1.2	4	1
3	2	6	1	4

Betreff: Frage zu wiederholten Messungen mit mehreren kontinuierlichen Variablen

Möglicherweise gibt es mehr als eine Möglichkeit, Ihre Studie zu analysieren. Im weiteren Verlauf benötigen wir möglicherweise weitere Hintergrundinformationen.

JMP kann eine Analyse wiederholter Messungen durchführen mehrere verschiedene Möglichkeiten . Die Tatsache, dass Sie an der Korrelation zwischen den Antworten interessiert sind, deutet darauf hin, dass eine partielle Analyse der kleinsten Quadrate (Partial Least Squares Analysis, PLS) ebenfalls nützlich sein könnte.

CBC und Bindungspotenzial sind also beide Reaktionen. Es gibt einen Faktor (Belichtung). Haben Sie den Zeitverlauf vor der Exposition untersucht oder nur eine Basislinie gemessen?

Sie benötigen eine Spalte für die Probanden-ID und eine weitere für die Faktorstufe.