Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesSalut tout le monde,
Je suis un nouvel utilisateur de JMP (et pas du tout un expert en statistiques !) avec une question sur les mesures répétées. J'ai un ensemble de données avec 10 sujets, qui ont chacun été mesurés entre 4 et 6 fois sur plusieurs semaines, avant et après exposition à un agent pathogène. À chaque point de mesure, le potentiel de liaison a été calculé et une numération globulaire complète a ÉGALEMENT été prise (il y a également eu quelques fois où une numération globulaire complète a été prise en l'absence de potentiel de liaison). Ce que nous espérons découvrir, c'est quelles variables du CBC sont les plus associées aux changements du potentiel de liaison. Parce que toutes nos variables sont continues, je n'ai pas trouvé de tutoriel qui corresponde à mes données (celui des chiens ne correspond pas vraiment). Je ne suis pas tout à fait sûr de savoir comment faire en sorte que JMP examine chaque animal séparément (ou si j'ai besoin de le faire), et comment faire en sorte que JMP tienne compte du fait que les données proviennent de la pré- ou de la post-exposition. En ce moment, j'ai organisé mes données dans le format "grand", et je ne suis pas sûr que cela fonctionnerait pour en faire un "large" (ou, du moins, cela donnerait environ 200 colonnes). Toute idée serait vraiment appréciée.
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesSalut Mark!
Merci beaucoup d'avoir travaillé avec moi ! Je fais des progrès.
J'avais une question sur un autre aspect de cette analyse. D'après ce que j'ai compris, la fonction Animal ID [Random] nous donne des interceptions aléatoires. Existe-t-il un moyen d'obtenir également des pentes aléatoires (je pense que cela s'appelle des coefficients aléatoires, n'est-ce pas ?) ? Je pense que JMP Pro offre cela -- puis-je également le faire avec une version non professionnelle de JMP ?J'ai essayé de répondre à cette question moi-même, mais je n'ai pas été en mesure de le faire avec certitude.
Encore une fois, merci beaucoup pour votre temps !
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesJe ne suis pas si sûr maintenant que PLS est la réponse. Il s'agit d'une analyse multivariée de données numériques et vous devez inclure Chien , lequel est catégorique . De plus, le Chien l'effet est aléatoire . Vous pourriez plutôt envisager un modèle à effets mixtes , car votre étude pourrait être considérée comme une conception en parcelles divisées dans lequel chaque chien est le parcelle entière . J'ai mis en place un exemple simple :
Je n'ai évidemment pas de valeurs de réponse. j'ai utilisé Radio-Canada 1 et Radio-Canada 2 pour représenter deux des comptes - vous en avez probablement plus. Traitons tous les résultats du CBC comme des facteurs/prédicteurs à effets fixes. Sélectionner Analyser > Ajuster le modèle et entrez les colonnes dans ces rôles :
Remarquerez que Chien est indiqué pour avoir un effet aléatoire. (Sélectionner Chien dans la liste des effets, cliquez sur le triangle rouge à côté de Les attributs , et sélectionnez Aléatoire .)
Vous pouvez inclure plus de termes dans le prédicteur linéaire, tels que d'autres colonnes CBC ou des transformations telles que des interactions ou des puissances, selon les besoins.
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesSi je vous comprends bien, vous avez au moins deux réponses dans le temps et vous souhaitez étudier/tester/modéliser leur corrélation. C'est exactement ce que PLS fera pour vous. Je vous suggère de vous procurer le livre, " Découvrir les moindres carrés partiels avec JMP ", qui explique PLS dans le cadre de la résolution de problèmes réels (études de cas). C'est un livre merveilleux sur cette technique importante.
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesSalut Mark,
Désolé si je n'ai pas été clair ! J'ai pris deux points de référence à des moments différents : 10 et 5 jours avant l'exposition (c'est pourquoi j'ai initialement mis les valeurs négatives). Les autres points temporels n'ont pas de mesures en double. Je vais ajuster les deux niveaux de facteur « jour d'infection » de base à 0. Les moindres carrés partiels semblent intéressants, et j'ai joué avec les options sur JMP, mais je ne peux pas dire si cela tiendra compte des mesures répétées.
Merci beaucoup de m'avoir supporté !
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesEffectuez-vous des mesures en double à tout moment (au départ et après l'exposition) ?
Je pense que votre facteur est implicitement inclus dans le point temporel (exposition = non si le temps est 0, exposition = oui si le temps> 0). vous pouvez inclure une colonne de données pour le facteur, mais je ne suis pas sûr que cela soit explicitement requis par l'analyse.
Pourquoi le « jour de l'infection » serait-il négatif ? Surveillez-vous quotidiennement pendant 10 jours avant l'exposition, puis quotidiennement après ? Je pensais que vous n'aviez pris que des mesures de base (temps = 0).
Je crois que vous pourriez utiliser un modèle PLS avec les 3 réponses par rapport au 1 prédicteur, le temps.
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesMerci beaucoup pour votre réponse Marc! Je vais regarder plus à l'analyse des moindres carrés partiels.
Le facteur est l'exposition, oui. Avant l'exposition, nous avons recueilli deux points temporels de base.
En ce moment, j'ai une colonne avec ID de sujet, avec plusieurs lignes pour chaque ID représentant différents moments. Pour le niveau de facteur, pourrait-il s'agir d'une variable continue (c'est-à-dire les jours d'infection, où la ligne de base est représentée par un nombre négatif) ? Par exemple, c'est analogue à la façon dont mes données sont organisées pour le moment, mais les chiffres sont inventés :
| Identifiant du sujet | Jour d'infection (niveau de facteur) | Variable x | variable y | Variable z |
| 1 | -dix | 1.5 | 5 | 0 |
| 1 | 2 | 6 | 5 | 0 |
| 1 | dix | 8 | 1 | 2 |
| 2 | -dix | .7 | 6 | 0 |
| 2 | 2 | 2 | 7 | 2 |
| 2 | dix | 5 | 3 | 4 |
| 3 | -dix | 1.2 | 4 | 1 |
| 3 | 2 | 6 | 1 | 4 |
Objet : Question sur les mesures répétées avec plusieurs variables continuesIl peut y avoir plus d'une façon d'analyser votre étude. Nous aurons peut-être besoin de plus d'informations contextuelles au fur et à mesure.
JMP peut effectuer une analyse de mesures répétées plusieurs manières différentes . Le fait que vous soyez intéressé par la corrélation entre les réponses suggère que l'analyse des moindres carrés partiels (PLS) pourrait également être utile.
Ainsi, le CBC et le potentiel de liaison sont les deux réponses. Il y a un facteur (l'exposition). Avez-vous étudié l'évolution dans le temps avant l'exposition ou n'avez-vous mesuré qu'une ligne de base ?
Vous aurez besoin d'une colonne pour l'identifiant du sujet et d'une autre pour le niveau du facteur.
