¿Cómo analizo un ANOVA de dos vías con dos factores de bloqueo?Tengo un experimento configurado como bloques completos aleatorizados, donde se plantan grupos de plantas replicados en bandejas. La bandeja actúa como factor de bloqueo, y dentro de cada bandeja hay 24 celdas donde se plantaron grupos de plantas. En cada celda de la bandeja hay una planta focal y plantas vecinas. Las plantas focales pueden ser altas o bajas, y las vecinas (colectivamente) pueden ser altas o bajas. Por lo tanto, el tratamiento 1 corresponde al tamaño de la planta focal y el tratamiento 2 al tamaño de la planta vecina. Todas las combinaciones de niveles de tratamiento aparecieron en cada bandeja 6 veces. A nivel de bandeja, algunas bandejas son de un genotipo particular, y otras son de un genotipo diferente (replicadas de 2 a 4 veces para cada genotipo). Por lo tanto, me pregunto si debo tratar todos los genotipos por separado (una serie de diseños RCB) o si puedo incluirlos juntos en un análisis general, donde el "genotipo" se considera un factor de bloqueo o incluso un tratamiento a nivel de bandeja (mientras que los tratamientos de tamaño se aleatorizaron dentro de las bandejas). La respuesta es el número de semillas. Espero que los genotipos difieran en general en cuanto al número de semillas, pero esto no me interesa realmente; solo me interesan los tratamientos de tamaño focal/vecino.
Si alguien puede sugerir un análisis, con referencia a la plataforma Fit Model (explicación interactiva), ¡sería muy apreciado!
Investigación de mercados y consumidoresExploración y visualización de datosDiseño de experimentosPersonalización masivaRe: ¿Cómo analizo un ANOVA de dos vías con dos factores de bloqueo?Actualicé el ejemplo de diseño para su caso.
Ordené las columnas para que la naturaleza de la parcela dividida sea evidente. (Supuse que aleatorizaste dentro de las parcelas completas). La clasificación también debería facilitarte la transferencia de resultados si ya completaste el experimento. Agregué una secuencia de comandos de tabla de distribución para que pueda explorar el diseño de manera interactiva y convencerse de que es RCBD.
Recuerda que siempre usé 4 bandejas por genotipo e incluí 5 genotipos, pero no sabía lo que realmente incluías. Cambié el nombre predeterminado de la columna de datos de Gráficos completos a Bandejas para reflejar cómo se manifestaron los gráficos completos.
Puede usar el script de la tabla de diálogo DOE para volver al diseño personalizado como lo especifiqué y modificarlo como mejor le parezca. Además, puede usar Cols> Recode para reemplazar fácilmente mi etiqueta (por ejemplo, G1) con la designación de genotipo real. Especifiqué el modelo para incluir todas las interacciones de dos factores y la interacción de tres factores según lo solicitado.
Espero que este caso sea una buena experiencia de aprendizaje (JMP, DOE), así que, por favor, pregunte si se atasca.
Re: ¿Cómo analizo un ANOVA de dos vías con dos factores de bloqueo?(Tenga en cuenta que modifiqué mi respuesta porque perdí el significado completo de su pregunta con respecto a los efectos de interacción).
Sí, este es un diseño de parcela dividida como lo describiste y como lo entiendo.
Sí, el diseño factorial completo es compatible con el modelo de interacción, así que incluya los siguientes términos: número de semilla = intercepción + planta focal + planta vecina + genotipo + (planta focal) * (planta vecina) + (planta focal) * (genotipo) + (planta vecina) * (genotipo) + (planta focal) * (planta vecina) * (genotipo) + error.
Re: ¿Cómo analizo un ANOVA de dos vías con dos factores de bloqueo?Gracias por esta respuesta, que es muy útil. Para aclarar la terminología, entonces: ¿llamaría al diseño una parcela dividida con genotipo que actúa a nivel de parcela completa (la bandeja) y los dos factores de tamaño de planta que actúan a nivel de parcela secundaria (las celdas dentro de las bandejas)? Y finalmente, en cuanto al término de interacción, estoy interesado en la interacción del tamaño de planta focal x tamaño de la planta vecina, pero también es necesario considerar las interacciones con el genotipo (por ejemplo, genotipo x tamaño de la planta focal x tamaño de la planta vecina). En otras palabras, ¿cuál sería el "modelo completo" para este diseño?
Re: ¿Cómo analizo un ANOVA de dos vías con dos factores de bloqueo?Su descripción es clara pero corríjame si me sale algo mal. Aclaremos algunos puntos importantes sobre el diseño después de decir que creo que deberían analizar todos los datos juntos, no por separado para cada genotipo.
Yo creo que genotipo es un difícil de cambiar factor porque no fue aleatorizado Fue replicado 2-4 veces. Estos grupos de carreras (una bandeja) son parcelas enteras no bloques . Variasteis los dos fácil de cambiar Factores dentro de cada gráfico completo como un diseño factorial completo replicado.
Imaginé que tienes cinco genotipos y siempre realizaste cuatro réplicas (bandejas). Puede eliminar grupos de filas si utiliza menos de cuatro bandejas. El genotipo es un efecto fijo y la trama completa es un efecto aleatorio. Adjunté un diseño para que pueda ver qué podría funcionar y cómo podría usarse. No incluí un término de interacción en el modelo, pero los datos apoyan la estimación de este efecto, no obstante.