Wie analysiere ich eine zweifaktorielle ANOVA mit zwei Blockfaktoren?Ich habe ein Experiment als randomisierte Blockanlage mit mehreren Pflanzengruppen in Anzuchtplatten durchgeführt. Die Anzuchtplatte dient als Blockfaktor. Jede Platte enthält 24 Zellen, in denen jeweils eine Pflanzengruppe platziert ist. In jeder Zelle befindet sich eine Fokuspflanze und benachbarte Pflanzen. Die Fokuspflanze kann entweder groß oder klein sein, und die benachbarten Pflanzen (gemeinsam) können ebenfalls groß oder klein sein. Behandlung 1 bezieht sich auf die Größe der Fokuspflanze, Behandlung 2 auf die Größe der benachbarten Pflanzen. Alle Behandlungskombinationen wurden in jeder Anzuchtplatte sechsmal durchgeführt. Auf Anzuchtplattenebene enthalten einige Platten ausschließlich Pflanzen eines bestimmten Genotyps, andere Platten ausschließlich Pflanzen eines anderen Genotyps (jeweils 2-4-fach repliziert). Ich frage mich nun, ob ich alle Genotypen separat behandeln muss (eine Reihe von randomisierten Blockanlagen) oder ob ich sie in einer Gesamtanalyse zusammenfassen kann, wobei der Genotyp entweder als Blockfaktor oder sogar als Behandlung auf Anzuchtplattenebene berücksichtigt wird (während die Größenbehandlungen innerhalb der Platten randomisiert wurden). Die Zielgröße ist die Anzahl der Samen. Ich gehe davon aus, dass sich die Genotypen insgesamt in der Anzahl der Samen unterscheiden, aber das interessiert mich nicht wirklich – mich interessieren nur die Größenunterschiede zwischen den untersuchten Pflanzen und ihren Nachbarn.
Falls jemand eine Analyse vorschlagen kann, unter Bezugnahme auf die Fit Model-Plattform (interaktive Erklärung), wäre das sehr willkommen!
Verbraucher- und MarktforschungDatenexploration und -visualisierungVersuchsplanungMassenanpassungRe: Wie analysiere ich eine Zweiwege-ANOVA mit zwei Blockierungsfaktoren?Ich habe das Designbeispiel für Ihren Fall aktualisiert.
Ich habe die Spalten so sortiert, dass die Split-Plot-Natur offensichtlich ist. (Ich ging davon aus, dass Sie innerhalb der gesamten Diagramme randomisiert wurden.) Die Sortierung sollte es Ihnen auch erleichtern, Ergebnisse zu übertragen, wenn Sie das Experiment bereits abgeschlossen haben. Ich habe ein Verteilungstabellenskript hinzugefügt, damit Sie das Design interaktiv erkunden können, um sich selbst davon zu überzeugen, dass es sich um RCBD handelt.
Denken Sie daran, dass ich immer 4 Schalen pro Genotyp verwendet habe und 5 Genotypen enthalten habe, aber ich wusste nicht, was Sie tatsächlich enthalten. Ich habe den standardmäßigen Whole Plots-Datenspaltennamen in Trays geändert, um die Darstellung der gesamten Plots widerzuspiegeln.
Sie können das DOE-Dialog-Tabellenskript verwenden, um zum angegebenen benutzerdefinierten Design zurückzukehren und es nach Bedarf zu ändern. Sie können auch Cols> Recode verwenden, um mein Label (z. B. G1) durch die tatsächliche Genotyp-Bezeichnung zu ersetzen. Ich habe angegeben, dass das Modell alle Zwei-Faktor-Interaktionen und die Drei-Faktor-Interaktion wie gewünscht umfasst.
Ich hoffe, dass dieser Fall eine gute Lernerfahrung ist (JMP, DOE). Fragen Sie also bitte nach etwas, wenn Sie nicht weiterkommen.
Re: Wie analysiere ich eine Zweiwege-ANOVA mit zwei Blockierungsfaktoren?(Beachten Sie, dass ich meine Antwort modifiziert habe, weil ich Ihre Frage bezüglich der Interaktionseffekte nicht vollständig verstanden habe.)
Ja, dies ist ein Split-Plot-Design, wie Sie es beschrieben haben und wie ich es verstehe.
Ja, das vollständige faktorielle Design unterstützt das Interaktionsmodell. Fügen Sie die Kreuzbegriffe wie folgt hinzu: Saatennummer = Schnittpunkt + Fokuspflanze + Nachbarpflanze + Genotyp + (Fokuspflanze) * (Nachbarpflanze) + (fokale Pflanze) * (Genotyp) + (Nachbarpflanze) * (Genotyp) + (Brennpflanze) * (Nachbarpflanze) * (Genotyp) + Fehler
Re: Wie analysiere ich eine Zweiwege-ANOVA mit zwei Blockierungsfaktoren?Danke für diese Antwort, die sehr hilfreich ist. Um die Terminologie zu klären, würden Sie das Design als Split-Plot bezeichnen, wobei der Genotyp auf der Ebene der gesamten Zeichnung (der Schale) und die beiden Faktoren der Pflanzengröße auf der Ebene der Unterzeichnung (die Zellen in den Trays) wirken. Was den Interaktionsausdruck anbelangt, so interessiert mich schließlich die Interaktion zwischen der fokalen Pflanzengröße und der benachbarten Pflanzengröße, aber es ist auch notwendig, Interaktionen mit dem Genotyp zu berücksichtigen (z. B. Genotyp x fokale Pflanzengröße x benachbarten Pflanzengröße). Mit anderen Worten, was wäre das "Vollmodell" für diesen Entwurf?
Re: Wie analysiere ich eine Zweiwege-ANOVA mit zwei Blockierungsfaktoren?Ihre Beschreibung ist klar, aber richtig, wenn ich etwas falsch verstanden habe. Lassen Sie uns einige wichtige Punkte über das Design klären, nachdem ich gesagt habe, dass Sie alle Daten zusammen analysieren sollten, nicht für jeden Genotyp.
Meiner Ansicht nach Genotyp ist ein schwer zu ändern Faktor, weil es nicht randomisiert wurde. Es wurde 2-4 mal repliziert. Diese Gruppen von Läufen (ein Tablett) sind ganze Grundstücke nicht Blöcke . Du hast die beiden variiert einfach zu ändern Faktoren innerhalb jedes Diagramms als repliziertes vollständiges faktorielles Design.
Ich stellte mir vor, dass Sie fünf Genotypen haben und immer vier Wiederholungen (Trays) durchgeführt haben. Sie können Gruppen von Zeilen löschen, wenn Sie weniger als vier Fächer verwendet haben. Der Genotyp ist ein fester Effekt und der gesamte Plot ist ein zufälliger Effekt. Ich habe ein Design angehängt, damit Sie sehen können, was möglicherweise funktioniert und wie es verwendet werden kann. Ich habe keinen Interaktionsausdruck in das Modell aufgenommen, die Daten unterstützen jedoch die Abschätzung dieses Effekts.