Comment analyser une ANOVA à deux facteurs avec deux facteurs de blocage ?J'ai mis en place une expérience selon un dispositif en blocs complets randomisés, où des groupes de plantes, répétés plusieurs fois, sont semés dans des plateaux. Le plateau constitue le facteur de blocage, et chaque plateau comporte 24 alvéoles, dans lesquelles j'ai semé des groupes de plantes. Dans chaque alvéole d'un plateau, on trouve une plante focale et des plantes voisines. Les plantes focales peuvent être de grande ou de petite taille, et les plantes voisines (collectivement) peuvent être de grande ou de petite taille. Ainsi, le traitement 1 correspond à la taille de la plante focale et le traitement 2 à la taille des plantes voisines. Toutes les combinaisons de niveaux de traitement ont été testées 6 fois dans chaque plateau. Au niveau du plateau, certains plateaux contiennent uniquement des plantes d'un génotype particulier, et d'autres plateaux contiennent des plantes d'un génotype différent (répliqué 2 à 4 fois pour chaque génotype). Je me demande donc si je dois traiter tous les génotypes séparément (une série de plans en blocs aléatoires complets), ou si je peux les inclure dans une analyse globale, où le « génotype » est considéré soit comme un facteur de blocage, soit même comme un traitement au niveau du plateau (alors que les traitements de taille sont randomisés au sein des plateaux). La variable réponse est le nombre de graines. Je m'attends à ce que les génotypes diffèrent globalement quant au nombre de graines, mais cela ne m'intéresse pas vraiment ; je m'intéresse uniquement aux traitements de taille étudiés.
Si quelqu'un peut proposer une analyse, en référence à la plateforme Fit Model (explication interactive), ce serait très apprécié !
Études de marché et de consommationExploration et visualisation des donnéesConception des expériencesPersonnalisation de masseRe: Comment analyser une ANOVA à deux voies avec deux facteurs de blocageJ'ai mis à jour l'exemple de conception pour votre cas.
J'ai trié les colonnes pour que la nature de la parcelle divisée soit apparente. (J'ai supposé que vous aviez randomisé toutes les parcelles.) Le tri devrait également faciliter le transfert des résultats si vous avez déjà terminé le test. J'ai ajouté un script de table de distribution afin que vous puissiez explorer le design de manière interactive pour vous convaincre qu'il s'agit de RCBD.
Rappelez-vous que j'ai toujours utilisé 4 plateaux par génotype et que j'ai inclus 5 génotypes, mais je ne savais pas ce que vous aviez inclus. J'ai changé le nom de colonne de données par défaut pour les tracés complets en Bacs afin de refléter la manière dont les tracés entiers étaient manifestés.
Vous pouvez utiliser le script de table DOE Dialog pour revenir à la conception personnalisée telle que j'ai spécifiée et la modifier à votre guise. En outre, vous pouvez utiliser Cols> Recode pour remplacer facilement mon étiquette (par exemple, G1) par la désignation du génotype réel. J'ai spécifié que le modèle devait inclure toutes les interactions à deux facteurs et l'interaction à trois facteurs, comme demandé.
J'espère que cette affaire est une bonne expérience d'apprentissage (JMP, DOE), alors n'hésitez pas à demander quoi que ce soit si vous êtes bloqué.
Re: Comment analyser une ANOVA à deux voies avec deux facteurs de blocage(Notez que j'ai modifié ma réponse car j'ai mal compris le sens de votre question concernant les effets d'interaction.)
Oui, il s'agit d'une conception en parcelles divisées telle que vous l'avez décrite et telle que je la comprends.
Oui, la conception factorielle complète prend en charge le modèle d'interaction. Vous devez donc inclure les termes croisés suivants: numéro de graine = intersection + plante focale + plante voisine + génotype + (plante focale) * (plante voisine) + (plante focale) * (génotype) + (plante voisine) * (génotype) + (plante focale) * (plante voisine) * (génotype) + erreur.
Re: Comment analyser une ANOVA à deux voies avec deux facteurs de blocageMerci pour cette réponse très utile. Pour clarifier la terminologie, alors: appelez-vous la conception un tracé divisé avec un génotype agissant au niveau du tracé entier (le plateau) et les deux facteurs de taille de la plante agissant au niveau du sous-tracé (les cellules dans les plateaux)? Enfin, en ce qui concerne le terme d’interaction, je suis intéressé par l’interaction taille centrale x taille voisine, mais il faut aussi tenir compte des interactions avec le génotype (par exemple génotype x taille focale x taille voisine). En d'autres termes, quel serait le "modèle complet" pour cette conception?
Re: Comment analyser une ANOVA à deux voies avec deux facteurs de blocageVotre description est claire mais corrigez-moi si quelque chose ne va pas. Clarifions quelques points importants concernant la conception après avoir déclaré que je pense que vous devriez analyser toutes les données ensemble, et non séparément pour chaque génotype.
je pense génotype est un difficile de changer facteur parce qu'il n'a pas été randomisé. Il a été répliqué 2 à 4 fois. Ces groupes de pistes (un plateau) sont parcelles entières , ne pas des blocs . Vous avez varié les deux facile à changer des facteurs dans chaque parcelle entière en tant que plan factoriel complet répliqué.
J'imaginais que vous aviez cinq génotypes et effectuais toujours quatre répétitions (plateaux). Vous pouvez supprimer des groupes de lignes si vous avez utilisé moins de quatre bacs. Le génotype est un effet fixe et toute la parcelle est un effet aléatoire. J'ai joint un dessin afin que vous puissiez voir ce qui pourrait fonctionner et comment il pourrait être utilisé. Je n'ai pas inclus de terme d'interaction dans le modèle, mais les données permettent néanmoins d'estimer cet effet.
