Matrice Covariance parziale di MANOVACiao,
Sto familiarizzando con la piattaforma Fit Model di JMP cercando di abbinare i risultati con MATLAB e MS Excel a mano lunga che ho calcolato.
Usando il file di dati di esempio "Cholesterol.jmp" ed eseguendo la piattaforma Fit Model con la personalità di MANOVA, ero un po 'confuso sul motivo per cui la mia matrice di Covariance parziale non corrispondeva esattamente alle mie matrici di Covariance in MATLAB e MS Excel.
Ecco l'output JMP:
Qui sta calcolando la Covariance Matrix in MS Excel:
Cov (x, y) = (1 / (N-1)) * sum ((Xi-Xbar) * (Yi-Ybar))
N = 20 (pazienti)
Ecco lo stesso risultato di MS Excel in MATLAB usando la funzione cov (x, y):
Forse non sto capendo quale sia la matrice di covarianza parziale, ma non dovrebbe essere identica alla matrice di covarianza?
Grazie.
Ri: Matrice di Covariance parziale di MANOVAMi sento come se avessi un passo in avanti per capire come JMP sta calcolando questa matrice parziale di covarianza, ma ancora non riesco a delimitarla.
Ho trovato una buona risorsa che descrive il metodo con un semplice esempio, ma non posso abbinare i risultati JMP per Cholesterol.jmp con sei variabili usando questa techique.
Causa e correlazione in biologia - Guida per l'utente all'analisi del percorso di Bill Shipley
PDF allegato.
Qualcuno da una mano?
Grazie!
Ri: Matrice di Covariance parziale di MANOVACiao Kevin,
Grazie per la risposta e la condivisione della risorsa testuale.
La matrice MS Excel che ho postato è stata creata manualmente da me senza alcun add-in, usando l'equazione della covarianza che ho elencato. Ho usato la funzione cov MATLAB imparziale per verificare che avessero lo stesso risultato.
Comprendo il concetto di correlazione parziale quando coinvolge tre variabili, ma nel caso del file Cholesterol.jmp ci sono sei variabili (colonne) di dati.
La correlazione parziale su Google ha una buona dose di risultati, ma non riesco a trovare alcuna informazione solida sulla covarianza parziale e la sua relazione matematica con la correlazione delle particelle.
Le matrici di covarianza che ho calcolato in MATLAB e MS Excel sono molto simili alla matrice di covarianza parziale di JMP con una leggera regolazione. Mi rendo conto che la covarianza e la covarianza parziale non sono la stessa cosa, ma in qualche modo sono collegati matematicamente.
Vorrei determinare le equazioni su come JMP sta generando quella matrice di covarianza parziale, dato che ci sono sei variabili di dati.
Ri: Matrice di Covariance parziale di MANOVACiao, bio_grad!
Innanzitutto, una breve lezione sulle matrici di covarianza parziale:
Un classico esempio è la correlazione positiva osservata tra il danno causato da un incendio e il numero di camion dei pompieri inviati al fuoco. È ovvio per quasi tutti che sarebbe folle cercare di ridurre il danno di un incendio inviando loro meno camion dei pompieri ... c'è una terza variabile, forse "taglia del fuoco", che influenza anche il danno. Se si dovesse mantenere la dimensione della costante di fuoco, si potrebbe anche vedere una correlazione negativa tra il danno e il numero di camion dei pompieri. Questo è ciò che la Correlazione Parziale e la Covarianza stanno cercando di fare usando i residui dal modello stimato. La covarianza e la covarianza parziale non sono la stessa cosa concettualmente e raramente e banalmente danno risultati identici. Raccomando Everitt, BS, Dunn. G. (2001) Analisi dati multivariata applicata (2nd Ed.) Oxford University Press per un trattamento più completo, se sei interessato. Lo ha anche Sir Ronald Aylmer Fisher scritto sulla correlazione parziale !
In secondo luogo, gli amici non permettono agli amici di usare Excel per le statistiche o anche per la matematica. La strada per l'inferno è lastricata di confronti tra i risultati del software indipendentemente dai pacchetti, ma Excel viene ripetutamente documentato come fare statistiche e matematica in modo errato. Fai attenzione ai risultati di Excel, anche se in questo caso sembra corrispondere a MATLAB. MATLAB ha grandi costolette di algebra matriciale, ma mi sembra che tu abbia fatto solo covarianza e covarianza parziale. Vero?
