Chère communauté,
J'ai un énorme ensemble de données RNAseq (nombre de lectures) et je veux juste transformer les lectures en différents styles. Je sais que le meilleur logiciel pour cela pourrait être le bioconducteur / R, mais comme j’utilise également JMP13, je me suis demandé s’il était possible de transformer mes données en un format de données box-cox ou stabilisant la variance en utilisant JMP.
Merci beaucoup pour votre aide,
Markus
Il existe un bel exemple de tableau de données illustrant Box-Cox dans JMP.
Aller à:
Aide ==> Bibliothèque de données exemple
puis ouvrez le tableau de données "Box-Cox".
Il y a un script incorporé dans la table de données appelé "Fit Model"
Exécutez ce script en cliquant sur la croix verte à côté du script
Dans la sortie affichée, faites défiler jusqu'au paragraphe Box-Cox. Le triangle rouge montre plusieurs actions que vous pouvez effectuer sur la transformation affichée.
Vous pouvez également utiliser le "?" outil, cliquez sur le graphique Transformations Box-Cox et obtenez une aide détaillée à l'écran.
Et, juste par curiosité, pourquoi pensez-vous " bioconductor / R "serait un meilleur choix que JMP?
