JMP Genomics 다중 위치 실험에서 QK 행렬을 맞추는 법<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />안녕하세요,
JMP Genomics를 사용하여 약 400 종의 품종으로 다중 위치 실험을 모델링했습니다. MAF = 0.05로 약 10.000 SNP가 유지됩니다. 재배 품종 간의 관련성을 고려하지 않은 분석은 괜찮은 것으로 보인다. 그러나, 나는 이들 품종 중 일부가 관련되어 있음을 안다. 그리고 모델링에서이를 설명하고자합니다. 특히 모든 위치를 동시에 분석 할 때 QK 행렬을 포함 시키려합니다.
이것을 설명하는 튜토리얼이 이미 존재한다면, 나는 그것에 대해 기뻐할 것이다. 그러나 그런 경우가 아니라면 문제에 대한 의견을 보내 주시면 감사하겠습니다.
감사
잔
제목 : Re : JMP Genomics 다중 위치 실험에서 QK 행렬을 맞추는 법안녕 Jahn,
좋은 질문입니다. 이것은 조금 복잡해지기 때문에 나는 이메일을 보낼 것을 제안 할 것이다. support@jmp.com 기술 지원 트랙을 열어 자세한 내용을 논의 할 수 있습니다. 일반적인 생각은 Q와 K 행렬이 각 위치에 대해 반복되는 동일한 블록으로 구성된다는 것입니다. 전체 데이터 세트를 사용하여 Q 및 K를 한 번에 모두 견적하거나 단일 위치에서 견적을 작성한 다음 다른 위치에 수동으로 (더 효율적으로) 복제 할 수 있습니다.
희망이 조금 도움이됩니다.
감사,
아담
