JMP基因組學如何在多位置實驗中擬合QK矩陣<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />嗨，
我正在使用JMP Genomics對大約400個品種進行多地點實驗建模。MAF = 0.05，大約10.000個SNP被保留。沒有考慮品種間相關性的分析似乎沒問題。但是，我知道其中一些品種是相關的。我想在建模中考慮到這一點。特別是，當我跨地點進行分析時，即在同時分析所有位置時，我想包括QK矩陣。
如果已經有一個描述這個的教程，我很樂意為它提供建議。但是，如果情況並非如此，我會很感激對我的問題的反饋。
謝謝
雅恩
回复：JMP基因組學如何在多位置實驗中擬合QK矩陣嗨Jahn，
好問題。 這有點複雜，所以我建議發電子郵件 support@jmp.com 打開技術支持跟踪，以便我們進一步討論細節。 一般的想法是你的Q和K矩陣將由為每個位置重複的相同塊組成。 您可以使用完整數據集並一次估算Q和K，或者您可以在單個位置估算它們，然後手動複製它們以獲得其他位置（更高效）。
希望有點幫助。
謝謝，
亞當
