<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Ciao,
Sto usando JMP Genomics per modellare un esperimento multi-posizione con circa 400 cultivar. Con un MAF = 0,05 vengono mantenuti circa 10.000 SNP. Le analisi senza tenere conto della correlazione tra le cultivar, sembrano essere OK. Tuttavia, so che alcune di queste cultivar sono correlate. E mi piacerebbe spiegarlo nella modellazione. In particolare, vorrei includere le matrici QK quando eseguo analisi su posizioni diverse, ovvero quando tutte le posizioni vengono analizzate contemporaneamente.
Se un tutorial che descrive questo già esiste, sarei felice di essere consigliato a questo. In caso contrario, tuttavia, apprezzerei il feedback sul mio problema.
Grazie
Jahn
Ciao Jahn,
Grande domanda. Questo diventa un po 'complicato, quindi suggerirei l'email support@jmp.com per aprire una traccia di supporto tecnico in modo da poter discutere ulteriormente i dettagli. L'idea generale è che le tue matrici Q e K saranno composte da blocchi identici ripetuti per ogni posizione. È possibile utilizzare l'intero set di dati e stimare Q e K tutti in una volta, oppure è possibile stimarli in un'unica posizione e quindi replicarli manualmente per le altre posizioni (più efficiente).
Spero che aiuti un po '.
Grazie,
Adamo
