JMP Genomicsマルチロケーション実験でQK行列をフィットさせる方法<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />こんにちは、
私はJMP Genomicsを使って、約400品種のマルチロケーション実験をモデル化しています。MAF = 0.05では約10,000のSNPが保持される。品種間の関連性を考慮せずに分析しても、問題ないようです。しかし、私はこれらの栽培品種のいくつかが関連していることを知っています。それをモデリングで説明します。特に、複数の場所にまたがって分析を行う場合、つまりすべての場所が同時に分析される場合は、QK行列を含めたいと思います。
これを説明するチュートリアルがすでに存在する場合は、ぜひそれを進めてください。そうでない場合は、しかし、私は私の問題に関するフィードバックをいただければ幸いです。
ありがとう
ヤーン
再：JMPゲノミクスマルチロケーション実験におけるQK行列の当てはめ方こんにちはJahn、
素晴らしい質問です。 これは少し複雑になるので、私は電子メールを送ることをお勧めします support@jmp.com 詳細をさらに議論できるように、テクニカルサポートトラックを開くこと。 一般的な考え方は、あなたのQとK行列は各位置に対して繰り返される同一のブロックから構成されるということです。 完全なデータセットを使用してQとKを一度に推定することも、1か所で推定してから他の場所に手動で複製することもできます（より効率的）。
それが少し役立つことを願っています。
ありがとう、
アダム
