마이크로티터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터microtiter plate reader를 사용하여 기록된 시간 경과 데이터를 구축하기 위해 그래프 빌더를 도와줄 수 있는 사람이 있습니까?
마이크로플레이트 맵에 대한 게시물을 읽었습니다.그것은 2 차원 데이터에 대한 것입니다. 시간 데이터로 지도 역할 데이터를 어떻게 정의할 수 있습니까? 감사해요
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터랩핑 기능을 이용해서 만들었어요!Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터시연에 감사드립니다! 거의 다 왔습니다. 스택 열은 정말 핵심입니다.
로컬 데이터 필터를 통해 개별적으로 표시할 수는 없지만 표시할 특정 열을 선택할 수 있습니다.
새로운 사용자로서 귀하와 Mark의 도움에 진심으로 감사드립니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터데이터가 누적되었습니다. 첫 번째 'n' 행은 첫 번째 생물반응기 용기에 대한 시간 경과 데이터에 해당하고 다음 'n'은 다음 생물반응기 용기 등에 해당합니다. Var는 y축에 있고 연령 또는 타임스탬프는 x에 있습니다. -축에서 bireactor는 래핑 변수 및/또는 데이터 필터 변수입니다.
데이터 테이블을 보고 이 모양으로 만들려면 먼저 데이터를 바꾼 다음 열을 쌓아야 합니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터데이터 테이블이 바뀐 것 같습니다. 위치, 시간 및 응답의 세 가지 열이 필요합니다. 따라서 예제에서 첫 번째 행을 제거하고 열 이름을 다음과 같이 바꿀 수 있습니다. 위치 , 562 , 1162 , 등등. 즉, 마지막에서 두 번째 열의 이름이 시간 값입니다. 그런 다음 모든 열을 쌓으십시오. 제외하고 첫번째 ( 위치 ). 새 데이터 열 이름 지정 응답 새 레이블 열 시간 . 데이터 유형을 숫자로 변경하고 모델링 유형을 연속으로 변경하십시오. 시간 . 이러한 변경 사항은 이 연습에 적합한 레이아웃을 제공해야 합니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터안녕 데이브,
데이터 테이블을 보여 주시겠습니까? 로컬 데이터 필터를 사용할 때 필터를 수행하는 데 사용하는 열은 무엇입니까?
다른 열을 어떻게 그룹화하고 생물 반응기로 정의합니까? info 컬럼에 리액터 이름을 넣었습니다. 따라서 각 열은 이 반응기에 대한 데이터입니다. 각 시점에 대해 데이터는 일련의 원자로에 대한 행입니다. 요약하면 시계열 열이 있고 모든 원자로가 닫힙니다. 필터로 선택할 열이 없습니다. 나는이 시점에서 붙어있다. 감사해요
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터환자의 답변에 감사드립니다. 이론적으로 귀하의 설명과 함께 그래프 빌드를 사용하는 방법을 이해합니다.
나는 당신이 테이블에 데이터를 입력하는 방법에 대해 여전히 한 지점에 갇혀 있다고 생각합니다. 내 데이터 형식에는 hh:mm:ss의 한 차원의 시계열과 한 차원의 웰 위치(A1, B2 등)가 있기 때문입니다. 열에 우물 ID를 입력하면 시간 데이터가 행에 표시됩니다. 내 정확한 시간 정보는 별도의 행으로 표시되지만 열 아래에는 데이터가 섞여 있습니다. 이 문제를 어떻게 처리합니까? 감사해요
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터고마워 데이빗. 이것은 해결책이 될 수 있습니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터이전에 말했듯이 그래프 빌더와 함께 로컬 데이터 필터를 사용하여 시간 변수로 디스플레이에 애니메이션을 적용할 수 있습니다. 맵 영역에서 웰 위치가 있는 데이터 열을 드롭합니다. 응답이 있는 데이터 열을 캔버스에 놓습니다. 이 정도는 '템플릿'과 동일합니다. 이제 빨간색 삼각형을 클릭하고 로컬 데이터 필터를 선택합니다. 시간이 있는 데이터 열을 선택하고 추가를 클릭합니다. 충분히 작게 간격을 변경한 다음 간격을 드래그하거나 로컬 데이터 필터 옆에 있는 빨간색 삼각형을 클릭하고 애니메이션을 선택합니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터지도를 사용할 필요가 있는지 잘 모르겠습니다. 시간에 대한 변수를 그래프로 표시하고 혈관으로 래핑하거나 필터링합니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터원하시면 샘플 데이터를 보내드릴 수 있습니다.
감사해요,
후이
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터예. 이해를 위해 이 템플릿을 사용했습니다. 내 응용 프로그램은 시간 경과 데이터인 하나의 우물에 대한 데이터 세트가 있는 경우입니다.
어떻게 그걸 그릴 수 있니?
후이
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터Graph Builder에서 마이크로타이터 플레이트 모양(웰)을 사용하려면 열과 행을 X와 Y로 드래그하지 마십시오. 대신 위치가 있는 열만 지도 영역으로 드래그하세요. 그러면 모양(8행 x 12열)이 표시됩니다. 그런 다음 응답이 있는 열을 도형 가운데로 끕니다.
JMP 커뮤니티의 파일 교환 섹션에서 다음 항목을 참조하십시오. 마이크로 역가 판 모양
사용 방법을 설명하고 의도한 대로 작동하는지 확인할 수 있도록 예제가 포함되어 있습니다. 예제를 사용하여 원하는 결과를 얻을 수 있는지 확인할 수도 있습니다.
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터답장을 보내 주셔서 감사합니다. 내 특정 데이터 분석은 효소 동역학 분석을 위한 것입니다.
각 웰에 96개의 웰에 대한 시간 경과 데이터가 있습니다. 플레이트 판독기의 레이아웃은 일반적으로 열 방향에서 다른 시간이고 행에서 다른 우물이라는 것입니다.
그런 다음 실제 판독 데이터가 테이블에 있습니다. 그래프 빌더에서 판독값을 Y로, 시간을 X로 그릴 수 있습니다. 96개의 웰 플레이트 레이아웃에서 어떻게 96개의 모든 데이터 세트를 Y 대 X 곡선으로 그릴 수 있습니까?
최상의,
후이
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터대답은 이 데이터로 수행하려는 작업에 따라 다릅니다. 예를 들어, 마이크로타이터 플레이트의 디스플레이를 보면서 시간 경과에 따른 반응의 변화를 조사하려는 경우 시간 변수를 필터링하도록 설정된 데이터 필터를 통해 애니메이션을 사용하고 간단히 새 필터를 추가할 수 있습니다. 시간 열. 우물 위치가 있는 기둥을 지도 영역으로 드래그하여 모양을 얻습니다. 응답이 있는 열을 캔버스로 드래그하여 평균 응답을 얻습니다. 이제 Graph Builder 옆에 있는 빨간색 삼각형을 클릭하고 script > Redo > Local Data Filter를 선택합니다. 필터 시간이 있는 열을 선택합니다.
이 예가 도움이 됩니까, 아니면 매우 다른 일을 하려고 합니까?
Re: 마이크로타이터 플레이트 형식의 시간 경과 데이터좋은 질문이네요. 96웰 포맷으로 시간 경과 데이터를 시각화하는 것은 확실히 까다로울 수 있습니다. 특히 플레이트의 반응 속도론과 공간적 레이아웃을 모두 보존하려고 할 때 더욱 그렇습니다.
제게 효과가 있었던 한 가지 방법은 먼저 원시 데이터를 각 행에 시간, 웰 ID(예: A1, A2 등), 그리고 해당 측정값을 포함하는 긴 형식으로 재구성하는 것입니다. 그런 다음 그래프 빌더에서 X축에 시간을, Y축에 응답을 할당할 수 있습니다. 플레이트 레이아웃을 시각적으로 유지하려면 웰 ID를 사용하여 데이터를 공간적으로 매핑합니다. 웰 ID를 맵 영역으로 드래그하면 플레이트에서 각 웰의 물리적 위치가 반영됩니다.
96개 웰 모두의 전체 동역학을 한 번에 보려면 작은 다중 패싯 플롯(패싯 플롯)을 사용하는 것도 고려해 볼 수 있습니다. 각 패널은 단일 웰의 시간 경과를 보여주므로 플레이트 전체에서 이상치, 추세 또는 패턴을 파악할 수 있습니다. 소프트웨어에서 지원하는 경우, 플레이트 레이아웃을 기준으로 행과 열로 패싯을 설정하면 해석이 더욱 쉬워집니다.
또한, 플레이트 매핑과 시각화를 보다 효과적으로 계획하는 데 이 96웰 플레이트 템플릿이 도움이 될 수 있습니다. 이는 데이터 구조를 마이크로타이터 플레이트의 물리적 레이아웃에 맞출 때 편리한 참고 자료입니다.
도움이 되길 바랍니다! 데이터셋을 재구성하거나 작은 다중 데이터셋을 설정하는 데 도움이 필요하면 알려주세요.
제목: 마이크로플레이트 형식의 시계열 데이터 관련일반적으로 효과적인 데이터 구조는 웰 또는 생물반응기별로 열을 유지하는 대신, 데이터를 긴(누적된) 형식으로 재구성하는 것입니다. 이 구조에서 각 행은 단일 측정값을 나타내며, 열에는 시간, 웰/생물반응기 ID, 반응, 그리고 선택적으로 처리 또는 플레이트 ID가 포함됩니다. 그런 다음 시간을 X축, 반응을 Y축에 할당하고, 웰/생물반응기를 그룹화, 색상 또는 줄 바꿈 변수로 사용할 수 있습니다.
제목: 마이크로플레이트 형식의 시계열 데이터 관련안녕하세요 @choufree 님
이 대화에 덧붙여 말씀드리자면, 플레이트를 시각화하는 또 다른 유용한 방법은 표준 플레이트 판독값(예: 웰당 최대 OD)과 시계열 데이터를 마우스 오버 시 표시되는 레이블과 함께 결합하는 것입니다(아래 참조).
이렇게 하려면 그래프 빌더에서 시계열 그래프를 만든 다음 빨간색 버튼 > 데이터 테이블로 만들기를 클릭합니다. 그러면 각 행에 대한 그래프 이미지가 생성됩니다. 이 이미지를 원래 테이블로 다시 가져온 다음(조인 또는 업데이트를 통해) 이미지 열을 레이블로 사용할 수 있습니다.
참고하실 수 있도록 데이터 테이블을 첨부합니다 (지도 폴더에 지도 셰이프 파일이 있어야 합니다).
감사해요,
벤
